More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0879 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
393 aa  798    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  67.46 
 
 
401 aa  540  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  62.47 
 
 
385 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  48.92 
 
 
416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3802  glycosyl transferase, group 1  49.46 
 
 
394 aa  342  7e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.769025  normal  0.0224743 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
379 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  33.95 
 
 
378 aa  226  6e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  32.37 
 
 
376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
381 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 
390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
387 aa  209  7e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
403 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.89 
 
 
380 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
380 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  33.6 
 
 
372 aa  204  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.89 
 
 
380 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  31.59 
 
 
381 aa  202  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
380 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.07 
 
 
380 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 
381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.73 
 
 
380 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 
380 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.55 
 
 
380 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
376 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  30.55 
 
 
380 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 
381 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
377 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42467  predicted protein  32.49 
 
 
679 aa  190  5e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  32.9 
 
 
382 aa  189  8e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  32.38 
 
 
381 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  32.56 
 
 
393 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  31.19 
 
 
382 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 
416 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  31.19 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
655 aa  184  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  32.55 
 
 
381 aa  182  7e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 
377 aa  182  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
383 aa  182  9.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  31.17 
 
 
382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 
400 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
406 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 
406 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 
373 aa  177  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
387 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
404 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
385 aa  176  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  32.36 
 
 
377 aa  176  8e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 
385 aa  176  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
382 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  32.79 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
434 aa  173  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  28.2 
 
 
377 aa  173  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37583  predicted protein  32.67 
 
 
400 aa  172  6.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17568  hitchhiker  0.00128126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  33.84 
 
 
381 aa  172  7.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.27 
 
 
403 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  29.17 
 
 
377 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  28.46 
 
 
377 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
377 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
396 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  33.05 
 
 
432 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
378 aa  169  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
377 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.59 
 
 
396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
378 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
405 aa  167  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  30.26 
 
 
385 aa  167  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  28.23 
 
 
373 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.06 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
390 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
390 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 
403 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
373 aa  162  8.000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
413 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  35.02 
 
 
426 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
374 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  33.54 
 
 
405 aa  159  8e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
406 aa  159  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
384 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
408 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
387 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
381 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07870  glycosyltransferase  31.06 
 
 
391 aa  157  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
427 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  31.39 
 
 
378 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
387 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
430 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1095  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
387 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
402 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
333 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.68 
 
 
769 aa  144  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  28.13 
 
 
441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2239  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
458 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 
420 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>