More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0974 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 400 aa  807    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  71.21 
 
 		 403 aa  573  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  71.13 
 
 		 396 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  74.53 
 
 		 406 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  73.99 
 
 		 406 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  68.1 
 
 		 396 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  68.12 
 
 		 396 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  69.23 
 
 		 406 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  69.45 
 
 		 404 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  73.07 
 
 		 406 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  68.1 
 
 		 403 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  50.8 
 
 		 432 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  54.38 
 
 		 413 aa  362  5.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  50.27 
 
 		 403 aa  348  7e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  49.87 
 
 		 373 aa  344  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  51.17 
 
 		 416 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  50.14 
 
 		 381 aa  338  7e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  53.24 
 
 		 408 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  47.58 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  44.88 
 
 		 655 aa  329  5.0000000000000004e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  48.39 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  48.39 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  47.57 
 
 		 385 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  43.62 
 
 		 405 aa  310  4e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  48.75 
 
 		 398 aa  285  7e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  41.52 
 
 		 441 aa  282  8.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  48.06 
 
 		 378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.48 
 
 		 373 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  40.63 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 383 aa  229  8e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  39.53 
 
 		 377 aa  229  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  39.06 
 
 		 381 aa  215  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 		 380 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.22 
 
 		 380 aa  202  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 380 aa  202  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.48 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.22 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.22 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  31.22 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.75 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 		 416 aa  199  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.48 
 
 		 380 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 381 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 		 377 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 379 aa  189  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  28.92 
 
 		 376 aa  186  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 390 aa  186  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 		 377 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 		 377 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 363 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  30.29 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 		 378 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  33.87 
 
 		 377 aa  183  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  30.41 
 
 		 372 aa  183  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  35.17 
 
 		 384 aa  182  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 		 393 aa  180  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  34.63 
 
 		 871 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 381 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  32.11 
 
 		 385 aa  179  7e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 772 aa  178  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  31.78 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  31.78 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  34.85 
 
 		 816 aa  176  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  31.7 
 
 		 382 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  34.89 
 
 		 820 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  31.69 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 		 393 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  29.5 
 
 		 377 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  30.55 
 
 		 377 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  31.69 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  34.19 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  30.08 
 
 		 373 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 		 810 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 		 355 aa  169  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 		 342 aa  169  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  34.5 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  34.53 
 
 		 803 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  39.34 
 
 		 343 aa  167  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 		 345 aa  167  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 		 819 aa  166  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  32 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 		 354 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 		 375 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>