More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_18561 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_18561  SqdX  89.78 
 
 
377 aa  698    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  97.86 
 
 
377 aa  753    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  98.93 
 
 
377 aa  760    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  100 
 
 
373 aa  767    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  79.67 
 
 
382 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  79.67 
 
 
382 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  78.98 
 
 
382 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  74.39 
 
 
382 aa  591  1e-168  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  73.78 
 
 
381 aa  584  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  74.66 
 
 
381 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  65.14 
 
 
377 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  65.14 
 
 
377 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  64.15 
 
 
377 aa  502  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  63.41 
 
 
376 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  62.87 
 
 
378 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  63.14 
 
 
377 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  62.33 
 
 
385 aa  476  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  60.27 
 
 
377 aa  474  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  49.33 
 
 
385 aa  388  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  41.64 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  40.82 
 
 
387 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  43.28 
 
 
374 aa  296  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  39.08 
 
 
377 aa  295  9e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  39.19 
 
 
381 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  42.36 
 
 
507 aa  283  4.0000000000000003e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  39.73 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  41.4 
 
 
372 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  40.52 
 
 
383 aa  264  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.37 
 
 
380 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.64 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  35.37 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  35.64 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.37 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.11 
 
 
380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.37 
 
 
380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.84 
 
 
380 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  34.84 
 
 
380 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
381 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43286  predicted protein  37.5 
 
 
456 aa  241  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  normal  0.0628635 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43238  predicted protein  37.5 
 
 
456 aa  241  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169779  normal  0.020707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 
420 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  33.69 
 
 
381 aa  227  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  36.39 
 
 
373 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 
387 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07870  glycosyltransferase  34.13 
 
 
391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 
426 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 
416 aa  206  7e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
427 aa  206  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2239  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
385 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  36.28 
 
 
375 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  31.22 
 
 
393 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  31.49 
 
 
376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  31.69 
 
 
405 aa  196  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
413 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
403 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  34.7 
 
 
375 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 
434 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  31.99 
 
 
406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
381 aa  190  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
416 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.12 
 
 
403 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 
393 aa  186  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
390 aa  185  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  31.32 
 
 
406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  29.28 
 
 
372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
432 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 
396 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
396 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0755  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 
375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0761  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 
376 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0775  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 
376 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193821  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
405 aa  179  9e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  31.32 
 
 
406 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
373 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
387 aa  178  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
378 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
396 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.95 
 
 
373 aa  177  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
404 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
403 aa  176  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  30.73 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1095  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
381 aa  172  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
406 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
333 aa  169  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
382 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
400 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 
398 aa  169  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
393 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
385 aa  166  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
390 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
390 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  32.36 
 
 
816 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
819 aa  162  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  31.25 
 
 
350 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.324982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>