More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0817 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  91.54 
 
 		 396 aa  721    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  92.05 
 
 		 396 aa  723    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 396 aa  798    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  85.42 
 
 		 404 aa  684    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  73.91 
 
 		 406 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.34 
 
 		 403 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  74.37 
 
 		 406 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  71.13 
 
 		 400 aa  558  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  70.05 
 
 		 403 aa  544  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  68.64 
 
 		 406 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  70.11 
 
 		 406 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  53.83 
 
 		 413 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  52.15 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  51.6 
 
 		 403 aa  342  5.999999999999999e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  50.79 
 
 		 416 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  48.38 
 
 		 378 aa  335  7e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  48.38 
 
 		 381 aa  335  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  53.29 
 
 		 408 aa  330  4e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  48.53 
 
 		 373 aa  325  6e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  47.83 
 
 		 390 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  47.83 
 
 		 390 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  45.2 
 
 		 655 aa  316  5e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  47.72 
 
 		 385 aa  311  9e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  44.42 
 
 		 405 aa  301  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  47.17 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  39.85 
 
 		 441 aa  273  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  42.97 
 
 		 393 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  45.82 
 
 		 378 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.9 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  37.67 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  37.4 
 
 		 377 aa  216  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 381 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  31.83 
 
 		 380 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.28 
 
 		 380 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  39.53 
 
 		 416 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.83 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 		 380 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.83 
 
 		 380 aa  205  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.76 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.5 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.51 
 
 		 380 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  31.51 
 
 		 380 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 		 381 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  35.73 
 
 		 376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  34.22 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 		 377 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 		 377 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 		 363 aa  192  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  35.75 
 
 		 377 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  35.73 
 
 		 384 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  34.58 
 
 		 378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 		 394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  34.81 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  33.51 
 
 		 385 aa  189  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 		 420 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  42.62 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  29.87 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  33.69 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  33.69 
 
 		 382 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  34.75 
 
 		 382 aa  186  6e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 373 aa  186  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 387 aa  185  9e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  32.1 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  34.02 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  31.83 
 
 		 377 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  31.56 
 
 		 377 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  34.21 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  37.87 
 
 		 353 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  32.63 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  33.42 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 		 810 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  34.99 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  34.54 
 
 		 345 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  34.6 
 
 		 355 aa  180  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  35.31 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 		 772 aa  177  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 		 820 aa  178  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 		 385 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  37.29 
 
 		 352 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 378 aa  176  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  31.1 
 
 		 373 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  30.79 
 
 		 372 aa  176  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 		 385 aa  176  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  36.05 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  35.76 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  35.68 
 
 		 375 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  34.75 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  36.63 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>