More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3301 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  100 
 
 		 355 aa  729    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  68.63 
 
 		 393 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  66.67 
 
 		 393 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1446  glycosyl transferase, group 1  56.29 
 
 		 349 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.131032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4109  glycosyl transferase group 1  54.87 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  55.15 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  54.85 
 
 		 342 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2028  glycosyl transferase group 1  55.52 
 
 		 343 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0125805  normal  0.984429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  55.76 
 
 		 352 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  54.91 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  55.15 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1322  glycosyl transferase group 1  54.91 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  54.85 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  54.55 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4490  glycosyl transferase group 1  54.55 
 
 		 351 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  57.19 
 
 		 350 aa  363  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0114  glycosyl transferase group 1  55.59 
 
 		 360 aa  362  4e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0952  glycosyl transferase group 1  52.77 
 
 		 345 aa  362  4e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.45 
 
 		 344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.45 
 
 		 344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.45 
 
 		 344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.45 
 
 		 344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.45 
 
 		 344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.45 
 
 		 344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.45 
 
 		 344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4972  glycosyl transferase group 1  54.87 
 
 		 365 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.85 
 
 		 344 aa  361  9e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  54.55 
 
 		 372 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  53.55 
 
 		 350 aa  360  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  53.8 
 
 		 348 aa  360  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1745  glycosyl transferase group 1  55.49 
 
 		 358 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0727463  normal  0.415071 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  54.55 
 
 		 344 aa  358  9e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0695  glycosyl transferase, group 1  52.6 
 
 		 367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  53.71 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1312  glycosyl transferase, group 1  54.95 
 
 		 349 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2271  glycosyl transferase, group 1  54.24 
 
 		 344 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2294  glycosyl transferase group 1  54.24 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  52.98 
 
 		 394 aa  354  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1992  glycosyl transferase group 1  54.46 
 
 		 368 aa  354  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.984548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  53.33 
 
 		 350 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2235  glycosyl transferase group 1  53.33 
 
 		 350 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.260131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  55.45 
 
 		 375 aa  351  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6212  putative glycosyl transferase (group 1)  53.94 
 
 		 351 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2129  glycosyl transferase group 1  56.76 
 
 		 358 aa  349  4e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2084  hypothetical protein  53.03 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1793  glycosyl transferase group 1  56.47 
 
 		 358 aa  347  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  51.23 
 
 		 353 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0019  glycosyl transferase, group 1  51.46 
 
 		 342 aa  346  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4943  glycosyl transferase group 1  54.28 
 
 		 378 aa  342  7e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0579  glycosyl transferase, group 1  51.2 
 
 		 357 aa  339  5e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199745  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32760  Glycosyl transferase, group 1 protein  52.71 
 
 		 353 aa  338  7e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1660  diacylglycerol kinase  54.98 
 
 		 521 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2924  glycosyl transferase, group 1  51.92 
 
 		 350 aa  330  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  53.98 
 
 		 343 aa  328  6e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  51.52 
 
 		 345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  51.83 
 
 		 333 aa  325  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0133  glycosyl transferase, group 1  51.52 
 
 		 344 aa  324  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.865411  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1453  hypothetical protein  51.52 
 
 		 356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  49.13 
 
 		 354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3011  putative glycosyltransferase  48.51 
 
 		 380 aa  317  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  48.49 
 
 		 345 aa  318  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22600  putative glycosyl transferase  50.45 
 
 		 351 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.809409  hitchhiker  0.000260588 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3659  glycosyl transferase, group 1  48.35 
 
 		 354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1909  glycosyl transferase, group 1  49.7 
 
 		 351 aa  309  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0853148  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  47.16 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  45 
 
 		 367 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2293  glycosyl transferase, group 1  39.05 
 
 		 367 aa  216  5.9999999999999996e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  34.71 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 		 405 aa  186  7e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  35.15 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.88 
 
 		 396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 		 396 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 		 406 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 		 432 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.54 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.15 
 
 		 403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 		 390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 		 390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  32.26 
 
 		 377 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  32.27 
 
 		 406 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 413 aa  172  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 		 383 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 403 aa  172  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.71 
 
 		 380 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  34.49 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.08 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.27 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 		 378 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  32 
 
 		 406 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.45 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 		 403 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.54 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  30.54 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  34.4 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>