More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2235 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2084  hypothetical protein  90 
 
 		 356 aa  651    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2235  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 350 aa  711    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.260131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  98 
 
 		 350 aa  700    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  85.17 
 
 		 372 aa  616  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  80.46 
 
 		 375 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1322  glycosyl transferase group 1  77.49 
 
 		 343 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  76.9 
 
 		 343 aa  544  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2028  glycosyl transferase group 1  75.29 
 
 		 343 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0125805  normal  0.984429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  78.31 
 
 		 344 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  78.31 
 
 		 344 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  79.52 
 
 		 344 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  78.01 
 
 		 344 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  73.07 
 
 		 350 aa  528  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2294  glycosyl transferase group 1  78.01 
 
 		 344 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.02 
 
 		 344 aa  525  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2271  glycosyl transferase, group 1  78.31 
 
 		 344 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693911  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.73 
 
 		 344 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  73.72 
 
 		 342 aa  521  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.73 
 
 		 344 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.73 
 
 		 344 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.73 
 
 		 344 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.73 
 
 		 344 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.73 
 
 		 344 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.73 
 
 		 344 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1660  diacylglycerol kinase  78.96 
 
 		 521 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1453  hypothetical protein  55.97 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0133  glycosyl transferase, group 1  52.2 
 
 		 344 aa  371  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.865411  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0579  glycosyl transferase, group 1  53.25 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  55.89 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  54.71 
 
 		 363 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  55.89 
 
 		 393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  52.06 
 
 		 394 aa  358  9e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0019  glycosyl transferase, group 1  55.69 
 
 		 342 aa  358  9e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  51.96 
 
 		 333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  53.28 
 
 		 350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1992  glycosyl transferase group 1  54.3 
 
 		 368 aa  353  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.984548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  53.33 
 
 		 355 aa  352  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3659  glycosyl transferase, group 1  50.89 
 
 		 354 aa  351  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  50.57 
 
 		 353 aa  348  9e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4490  glycosyl transferase group 1  53.8 
 
 		 351 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  52.44 
 
 		 352 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  50.74 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  52.74 
 
 		 352 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1446  glycosyl transferase, group 1  51.52 
 
 		 349 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.131032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0952  glycosyl transferase group 1  50.61 
 
 		 345 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4109  glycosyl transferase group 1  50.3 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4972  glycosyl transferase group 1  51.2 
 
 		 365 aa  332  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0114  glycosyl transferase group 1  49.39 
 
 		 360 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  54.52 
 
 		 343 aa  328  8e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2924  glycosyl transferase, group 1  51.95 
 
 		 350 aa  328  9e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6212  putative glycosyl transferase (group 1)  51.52 
 
 		 351 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1909  glycosyl transferase, group 1  49.27 
 
 		 351 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0853148  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  49.56 
 
 		 354 aa  325  9e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0695  glycosyl transferase, group 1  47.97 
 
 		 367 aa  324  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3011  putative glycosyltransferase  49.39 
 
 		 380 aa  322  5e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32760  Glycosyl transferase, group 1 protein  50.61 
 
 		 353 aa  322  8e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1312  glycosyl transferase, group 1  50.29 
 
 		 349 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  49.7 
 
 		 355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  48.37 
 
 		 345 aa  318  7e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22600  putative glycosyl transferase  49.24 
 
 		 351 aa  318  9e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.809409  hitchhiker  0.000260588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4943  glycosyl transferase group 1  48.85 
 
 		 378 aa  317  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  49.7 
 
 		 348 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1745  glycosyl transferase group 1  51.67 
 
 		 358 aa  315  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0727463  normal  0.415071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1793  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 358 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2129  glycosyl transferase group 1  49.72 
 
 		 358 aa  308  8e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  48.49 
 
 		 345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2293  glycosyl transferase, group 1  41.62 
 
 		 367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  32.81 
 
 		 393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 		 377 aa  179  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  32.69 
 
 		 377 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  32.44 
 
 		 382 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  32.44 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 404 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.23 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 		 378 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 405 aa  169  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  32.8 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 		 406 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  32.55 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  31.35 
 
 		 377 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  32.11 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  32.43 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  30.94 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  31 
 
 		 380 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  31 
 
 		 380 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  31.44 
 
 		 377 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  31.44 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.58 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.19 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.3 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>