More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2084 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2084  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  719    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  91.43 
 
 		 350 aa  658    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2235  glycosyl transferase group 1  90 
 
 		 350 aa  651    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.260131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  85.71 
 
 		 372 aa  609  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  82.9 
 
 		 375 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  79.34 
 
 		 343 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1322  glycosyl transferase group 1  78.01 
 
 		 343 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  79.82 
 
 		 344 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2028  glycosyl transferase group 1  78.01 
 
 		 343 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0125805  normal  0.984429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  79.22 
 
 		 344 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  78.92 
 
 		 344 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  74 
 
 		 350 aa  532  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  80.12 
 
 		 344 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2294  glycosyl transferase group 1  78.92 
 
 		 344 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2271  glycosyl transferase, group 1  79.22 
 
 		 344 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693911  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.25 
 
 		 344 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.25 
 
 		 344 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.25 
 
 		 344 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.25 
 
 		 344 aa  519  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.25 
 
 		 344 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.25 
 
 		 344 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.25 
 
 		 344 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.25 
 
 		 344 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  72.51 
 
 		 342 aa  513  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1660  diacylglycerol kinase  78.96 
 
 		 521 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1453  hypothetical protein  56.8 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0579  glycosyl transferase, group 1  53.39 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  55.22 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0133  glycosyl transferase, group 1  53.67 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.865411  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  55.06 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  54.97 
 
 		 350 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3659  glycosyl transferase, group 1  52.68 
 
 		 354 aa  356  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  51.74 
 
 		 394 aa  355  5e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  53.53 
 
 		 363 aa  355  6.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  51.96 
 
 		 333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0019  glycosyl transferase, group 1  55.56 
 
 		 342 aa  352  5e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1992  glycosyl transferase group 1  54.3 
 
 		 368 aa  351  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.984548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  53.03 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4109  glycosyl transferase group 1  52.73 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0952  glycosyl transferase group 1  51.83 
 
 		 345 aa  346  4e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  51.3 
 
 		 353 aa  344  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  53.35 
 
 		 352 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  53.66 
 
 		 352 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  51.04 
 
 		 367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4490  glycosyl transferase group 1  52.31 
 
 		 351 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1446  glycosyl transferase, group 1  51.52 
 
 		 349 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.131032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2924  glycosyl transferase, group 1  53.57 
 
 		 350 aa  335  9e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4972  glycosyl transferase group 1  53.31 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0114  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 360 aa  332  5e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6212  putative glycosyl transferase (group 1)  51.79 
 
 		 351 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1909  glycosyl transferase, group 1  50.15 
 
 		 351 aa  325  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0853148  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0695  glycosyl transferase, group 1  47.31 
 
 		 367 aa  325  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3011  putative glycosyltransferase  50.3 
 
 		 380 aa  324  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  49.7 
 
 		 355 aa  323  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32760  Glycosyl transferase, group 1 protein  50.44 
 
 		 353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22600  putative glycosyl transferase  50.46 
 
 		 351 aa  318  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.809409  hitchhiker  0.000260588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  51.2 
 
 		 348 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4943  glycosyl transferase group 1  50.43 
 
 		 378 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1312  glycosyl transferase, group 1  50.29 
 
 		 349 aa  317  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  49.26 
 
 		 354 aa  316  5e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  54.01 
 
 		 343 aa  315  8e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1745  glycosyl transferase group 1  51.49 
 
 		 358 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0727463  normal  0.415071 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  47.63 
 
 		 345 aa  311  9e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1793  glycosyl transferase group 1  50.7 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2129  glycosyl transferase group 1  50.42 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  48.2 
 
 		 345 aa  295  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2293  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  33.06 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 383 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 377 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.46 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 404 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 403 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 378 aa  166  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  31.32 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.29 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 		 406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  30.29 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 		 396 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.19 
 
 		 380 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  30.91 
 
 		 382 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 		 381 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.87 
 
 		 380 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 380 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  30.91 
 
 		 382 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.5 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  31.45 
 
 		 377 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.56 
 
 		 380 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.56 
 
 		 380 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  30.41 
 
 		 385 aa  158  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 		 400 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.277341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>