More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3011 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3011  putative glycosyltransferase  100 
 
 
380 aa  763    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  60.41 
 
 
367 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  50.61 
 
 
342 aa  350  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  52.87 
 
 
350 aa  349  4e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1453  hypothetical protein  54.85 
 
 
356 aa  349  5e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0952  glycosyl transferase group 1  52.28 
 
 
345 aa  346  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  52.12 
 
 
344 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2028  glycosyl transferase group 1  50.61 
 
 
343 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0125805  normal  0.984429 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  52.12 
 
 
344 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  51.82 
 
 
344 aa  339  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  53.64 
 
 
333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  53.03 
 
 
344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1322  glycosyl transferase group 1  50.61 
 
 
343 aa  335  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3659  glycosyl transferase, group 1  49.55 
 
 
354 aa  335  7e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631125  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  50.61 
 
 
343 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0114  glycosyl transferase group 1  51.53 
 
 
360 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  50.61 
 
 
372 aa  332  8e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0133  glycosyl transferase, group 1  51.04 
 
 
344 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.865411  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0579  glycosyl transferase, group 1  52.89 
 
 
357 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199745  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2294  glycosyl transferase group 1  51.52 
 
 
344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  51.06 
 
 
353 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2271  glycosyl transferase, group 1  51.52 
 
 
344 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693911  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0695  glycosyl transferase, group 1  50.29 
 
 
367 aa  326  5e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  50.7 
 
 
375 aa  325  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  51.23 
 
 
352 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2084  hypothetical protein  50.3 
 
 
356 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4490  glycosyl transferase group 1  49.14 
 
 
351 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  49.7 
 
 
350 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.74 
 
 
344 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.74 
 
 
344 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.74 
 
 
344 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.74 
 
 
344 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.74 
 
 
344 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1446  glycosyl transferase, group 1  49.4 
 
 
349 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.131032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2235  glycosyl transferase group 1  49.39 
 
 
350 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.260131 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.74 
 
 
344 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.74 
 
 
344 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6212  putative glycosyl transferase (group 1)  50 
 
 
351 aa  322  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.45 
 
 
344 aa  322  8e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4109  glycosyl transferase group 1  49.39 
 
 
355 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719344  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  48.51 
 
 
355 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  49.09 
 
 
393 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 
352 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4972  glycosyl transferase group 1  48.13 
 
 
365 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1660  diacylglycerol kinase  52.43 
 
 
521 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0019  glycosyl transferase, group 1  50.45 
 
 
342 aa  309  6.999999999999999e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  50.15 
 
 
348 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2129  glycosyl transferase group 1  51.06 
 
 
358 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1745  glycosyl transferase group 1  50.45 
 
 
358 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0727463  normal  0.415071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1992  glycosyl transferase group 1  47.71 
 
 
368 aa  301  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.984548  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1793  glycosyl transferase group 1  50.76 
 
 
358 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  48.07 
 
 
394 aa  298  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2924  glycosyl transferase, group 1  52.4 
 
 
350 aa  297  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4943  glycosyl transferase group 1  47.01 
 
 
378 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  48.17 
 
 
393 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  48.22 
 
 
354 aa  291  9e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22600  putative glycosyl transferase  49.39 
 
 
351 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.809409  hitchhiker  0.000260588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1909  glycosyl transferase, group 1  48.78 
 
 
351 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0853148  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  49.26 
 
 
350 aa  286  4e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32760  Glycosyl transferase, group 1 protein  49.69 
 
 
353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1312  glycosyl transferase, group 1  46.81 
 
 
349 aa  282  9e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  48.34 
 
 
345 aa  279  8e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  44.38 
 
 
355 aa  276  6e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  44.97 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  44.11 
 
 
345 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  48.21 
 
 
343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2293  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
367 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  35.79 
 
 
416 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 
403 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.21 
 
 
396 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  35.4 
 
 
393 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
404 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  32.79 
 
 
406 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 
396 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.7 
 
 
403 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
406 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
413 aa  149  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
373 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 
390 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.28 
 
 
373 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  34.28 
 
 
378 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 
390 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
400 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
655 aa  142  9e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  31.13 
 
 
377 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  29.4 
 
 
385 aa  140  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  34.22 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 
398 aa  140  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  31.45 
 
 
381 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
381 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  31.9 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  31.9 
 
 
406 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
379 aa  136  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>