More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1822 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 345 aa  691    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32760  Glycosyl transferase, group 1 protein  75.88 
 
 		 353 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1909  glycosyl transferase, group 1  72.87 
 
 		 351 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0853148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22600  putative glycosyl transferase  72.73 
 
 		 351 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.809409  hitchhiker  0.000260588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  51.52 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1446  glycosyl transferase, group 1  50.77 
 
 		 349 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.131032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  50.31 
 
 		 350 aa  316  4e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  46.77 
 
 		 342 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4490  glycosyl transferase group 1  51.53 
 
 		 351 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1453  hypothetical protein  51.03 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  51.53 
 
 		 352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  48.87 
 
 		 350 aa  309  4e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  49.1 
 
 		 344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  49.25 
 
 		 372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  49.1 
 
 		 344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  48.48 
 
 		 393 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0579  glycosyl transferase, group 1  49.4 
 
 		 357 aa  306  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  50.92 
 
 		 352 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  49.1 
 
 		 344 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2235  glycosyl transferase group 1  48.49 
 
 		 350 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.260131 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  50 
 
 		 344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  50.15 
 
 		 375 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  48.49 
 
 		 350 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  47.15 
 
 		 394 aa  300  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0952  glycosyl transferase group 1  47.72 
 
 		 345 aa  300  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2028  glycosyl transferase group 1  48.34 
 
 		 343 aa  299  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0125805  normal  0.984429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  48.8 
 
 		 343 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.7 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.7 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.7 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1322  glycosyl transferase group 1  48.49 
 
 		 343 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.7 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.7 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.7 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.7 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2271  glycosyl transferase, group 1  49.4 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2294  glycosyl transferase group 1  49.4 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  49.25 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2084  hypothetical protein  48.2 
 
 		 356 aa  295  8e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0019  glycosyl transferase, group 1  49.85 
 
 		 342 aa  295  8e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  50.76 
 
 		 333 aa  293  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  47.08 
 
 		 355 aa  293  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  51.51 
 
 		 348 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0695  glycosyl transferase, group 1  44.13 
 
 		 367 aa  288  8e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1660  diacylglycerol kinase  50.65 
 
 		 521 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4972  glycosyl transferase group 1  49.7 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0133  glycosyl transferase, group 1  49.4 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.865411  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4109  glycosyl transferase group 1  46.65 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  46.65 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6212  putative glycosyl transferase (group 1)  46.71 
 
 		 351 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  47.09 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  47.87 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0114  glycosyl transferase group 1  47.4 
 
 		 360 aa  281  8.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1992  glycosyl transferase group 1  47.9 
 
 		 368 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.984548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2924  glycosyl transferase, group 1  50.3 
 
 		 350 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1312  glycosyl transferase, group 1  48.62 
 
 		 349 aa  278  7e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3011  putative glycosyltransferase  48.34 
 
 		 380 aa  279  7e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3659  glycosyl transferase, group 1  44.44 
 
 		 354 aa  278  8e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  46.73 
 
 		 367 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1745  glycosyl transferase group 1  49.7 
 
 		 358 aa  276  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0727463  normal  0.415071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  44.48 
 
 		 363 aa  275  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  49.55 
 
 		 343 aa  269  5.9999999999999995e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4943  glycosyl transferase group 1  48.18 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1793  glycosyl transferase group 1  49.09 
 
 		 358 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2129  glycosyl transferase group 1  49.09 
 
 		 358 aa  261  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2293  glycosyl transferase, group 1  39.16 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  32.91 
 
 		 377 aa  172  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  38.39 
 
 		 393 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 		 376 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  37.2 
 
 		 413 aa  162  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  36.45 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  36.45 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  30.97 
 
 		 385 aa  159  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  35.05 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  35.87 
 
 		 373 aa  155  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 404 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  36.62 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 385 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  34.81 
 
 		 403 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 		 405 aa  149  6e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 381 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  31.11 
 
 		 381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 		 381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  31.96 
 
 		 381 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.47 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 		 403 aa  146  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  31.83 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  33.62 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.61 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>