More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2129 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1745  glycosyl transferase group 1  92.18 
 
 
358 aa  637    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0727463  normal  0.415071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2129  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
358 aa  708    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1793  glycosyl transferase group 1  99.72 
 
 
358 aa  706    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4972  glycosyl transferase group 1  75.07 
 
 
365 aa  521  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4943  glycosyl transferase group 1  75.14 
 
 
378 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  68.01 
 
 
348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4109  glycosyl transferase group 1  61.05 
 
 
355 aa  401  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719344  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0114  glycosyl transferase group 1  58.54 
 
 
360 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0952  glycosyl transferase group 1  59.48 
 
 
345 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  54.78 
 
 
393 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1446  glycosyl transferase, group 1  57.1 
 
 
349 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.131032  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4490  glycosyl transferase group 1  59.88 
 
 
351 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  59.46 
 
 
352 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  58.86 
 
 
352 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  56.76 
 
 
355 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0695  glycosyl transferase, group 1  55.71 
 
 
367 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6212  putative glycosyl transferase (group 1)  58.98 
 
 
351 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  54.21 
 
 
393 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1312  glycosyl transferase, group 1  57.69 
 
 
349 aa  351  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  52.96 
 
 
353 aa  345  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0579  glycosyl transferase, group 1  54.17 
 
 
357 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199745  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  50.85 
 
 
350 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2028  glycosyl transferase group 1  51.37 
 
 
343 aa  332  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0125805  normal  0.984429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1322  glycosyl transferase group 1  51.98 
 
 
343 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  52.28 
 
 
343 aa  329  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  50.3 
 
 
363 aa  328  9e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2235  glycosyl transferase group 1  49.72 
 
 
350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.260131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  50.45 
 
 
344 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1992  glycosyl transferase group 1  52.21 
 
 
368 aa  325  8.000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.984548  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  49.44 
 
 
350 aa  325  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  51.35 
 
 
372 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2084  hypothetical protein  50.42 
 
 
356 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  49.85 
 
 
344 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  51 
 
 
375 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  50.45 
 
 
344 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  48.05 
 
 
342 aa  322  6e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1453  hypothetical protein  51.37 
 
 
356 aa  322  8e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0133  glycosyl transferase, group 1  51.86 
 
 
344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.865411  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.87 
 
 
344 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.87 
 
 
344 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.87 
 
 
344 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  51.05 
 
 
344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  49.11 
 
 
394 aa  319  3.9999999999999996e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.87 
 
 
344 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.87 
 
 
344 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.87 
 
 
344 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.87 
 
 
344 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3011  putative glycosyltransferase  51.06 
 
 
380 aa  318  6e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  50.45 
 
 
344 aa  318  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2294  glycosyl transferase group 1  49.85 
 
 
344 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2271  glycosyl transferase, group 1  49.85 
 
 
344 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693911  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  52.1 
 
 
333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2924  glycosyl transferase, group 1  54.73 
 
 
350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  48.84 
 
 
354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  54.55 
 
 
350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3659  glycosyl transferase, group 1  48.5 
 
 
354 aa  312  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631125  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0019  glycosyl transferase, group 1  51.52 
 
 
342 aa  305  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1660  diacylglycerol kinase  50.96 
 
 
521 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  47.01 
 
 
345 aa  297  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  51.76 
 
 
343 aa  296  5e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  43.82 
 
 
367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  45.07 
 
 
355 aa  282  5.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32760  Glycosyl transferase, group 1 protein  50 
 
 
353 aa  282  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  49.09 
 
 
345 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1909  glycosyl transferase, group 1  49.7 
 
 
351 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0853148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22600  putative glycosyl transferase  49.39 
 
 
351 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.809409  hitchhiker  0.000260588 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2293  glycosyl transferase, group 1  43.15 
 
 
367 aa  243  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  40.13 
 
 
403 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  38.82 
 
 
393 aa  179  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
416 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 
404 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  35.36 
 
 
396 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.69 
 
 
396 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  39.03 
 
 
413 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.42 
 
 
403 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  37.62 
 
 
390 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 
406 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  37.62 
 
 
390 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
383 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 
377 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
408 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  32.37 
 
 
377 aa  153  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  34.58 
 
 
406 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
405 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  38.74 
 
 
378 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.74 
 
 
373 aa  150  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
403 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  34.95 
 
 
655 aa  149  7e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
385 aa  149  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 
441 aa  145  9e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  35.76 
 
 
434 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  36.6 
 
 
398 aa  143  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 
373 aa  142  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 
378 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  33.44 
 
 
381 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 
385 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  28.88 
 
 
382 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  29.14 
 
 
382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>