More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1992 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1992  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
368 aa  751    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.984548  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  57.74 
 
 
350 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  54.76 
 
 
342 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2028  glycosyl transferase group 1  55.65 
 
 
343 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0125805  normal  0.984429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  54.33 
 
 
393 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1322  glycosyl transferase group 1  55.95 
 
 
343 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  55.65 
 
 
344 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  55.36 
 
 
343 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  54.9 
 
 
372 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  55.65 
 
 
344 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  54.9 
 
 
350 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  55.06 
 
 
344 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2235  glycosyl transferase group 1  54.3 
 
 
350 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.260131 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  54.46 
 
 
355 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0579  glycosyl transferase, group 1  55.19 
 
 
357 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199745  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2084  hypothetical protein  54.3 
 
 
356 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1446  glycosyl transferase, group 1  54.25 
 
 
349 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.131032  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  55.62 
 
 
352 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  54.76 
 
 
352 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  56.25 
 
 
344 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2271  glycosyl transferase, group 1  55.36 
 
 
344 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2294  glycosyl transferase group 1  55.36 
 
 
344 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  56.18 
 
 
350 aa  359  4e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.46 
 
 
344 aa  359  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  52.65 
 
 
363 aa  358  7e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.23 
 
 
344 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.23 
 
 
344 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.23 
 
 
344 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.23 
 
 
344 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.23 
 
 
344 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.23 
 
 
344 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.23 
 
 
344 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  54.6 
 
 
375 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4490  glycosyl transferase group 1  53.27 
 
 
351 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  53.13 
 
 
393 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6212  putative glycosyl transferase (group 1)  53.06 
 
 
351 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  52.51 
 
 
394 aa  352  4e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4109  glycosyl transferase group 1  51.48 
 
 
355 aa  349  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719344  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0133  glycosyl transferase, group 1  50.42 
 
 
344 aa  348  9e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.865411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0019  glycosyl transferase, group 1  53.85 
 
 
342 aa  347  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  51.63 
 
 
333 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0114  glycosyl transferase group 1  51.93 
 
 
360 aa  342  9e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1660  diacylglycerol kinase  56.15 
 
 
521 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4972  glycosyl transferase group 1  51.19 
 
 
365 aa  338  7e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1312  glycosyl transferase, group 1  52.03 
 
 
349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  51.73 
 
 
353 aa  334  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3659  glycosyl transferase, group 1  49.85 
 
 
354 aa  333  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631125  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0695  glycosyl transferase, group 1  48.87 
 
 
367 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  49.44 
 
 
354 aa  331  1e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  49.71 
 
 
348 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  51.04 
 
 
345 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0952  glycosyl transferase group 1  50.15 
 
 
345 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  54.03 
 
 
343 aa  324  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2924  glycosyl transferase, group 1  52.52 
 
 
350 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4943  glycosyl transferase group 1  50.43 
 
 
378 aa  323  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1745  glycosyl transferase group 1  51.18 
 
 
358 aa  322  8e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0727463  normal  0.415071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  49.26 
 
 
367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32760  Glycosyl transferase, group 1 protein  49.85 
 
 
353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2129  glycosyl transferase group 1  52.21 
 
 
358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1793  glycosyl transferase group 1  52.21 
 
 
358 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3011  putative glycosyltransferase  47.71 
 
 
380 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  48.25 
 
 
355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1453  hypothetical protein  46.7 
 
 
356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1909  glycosyl transferase, group 1  47.14 
 
 
351 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0853148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  47.9 
 
 
345 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22600  putative glycosyl transferase  46.57 
 
 
351 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.809409  hitchhiker  0.000260588 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2293  glycosyl transferase, group 1  40.23 
 
 
367 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  36.48 
 
 
393 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
404 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 
378 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 
396 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
403 aa  176  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  33.42 
 
 
406 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  31.25 
 
 
377 aa  172  9e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 
396 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  33.15 
 
 
406 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.87 
 
 
396 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
400 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
376 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  31.97 
 
 
385 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
377 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  32.16 
 
 
382 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  36.19 
 
 
390 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  36.19 
 
 
390 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  34.07 
 
 
378 aa  170  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  36.6 
 
 
416 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  32.16 
 
 
382 aa  169  8e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
373 aa  169  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 
377 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 
405 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.5 
 
 
380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
377 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
377 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  32.8 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  31.72 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.94 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>