More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0940 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
375 aa  764    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  82.45 
 
 
372 aa  610  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  81.32 
 
 
350 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2084  hypothetical protein  82.9 
 
 
356 aa  590  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2235  glycosyl transferase group 1  80.46 
 
 
350 aa  587  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.260131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  76.25 
 
 
344 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2028  glycosyl transferase group 1  76.67 
 
 
343 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0125805  normal  0.984429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  76.25 
 
 
344 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  75.95 
 
 
344 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  77.34 
 
 
343 aa  534  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  77.58 
 
 
350 aa  532  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  77.13 
 
 
344 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1322  glycosyl transferase group 1  77.04 
 
 
343 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.37 
 
 
344 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.37 
 
 
344 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.37 
 
 
344 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.37 
 
 
344 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.37 
 
 
344 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.07 
 
 
344 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2271  glycosyl transferase, group 1  75.66 
 
 
344 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2294  glycosyl transferase group 1  75.37 
 
 
344 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.37 
 
 
344 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.37 
 
 
344 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  71.39 
 
 
342 aa  514  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1660  diacylglycerol kinase  77.35 
 
 
521 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1453  hypothetical protein  60.06 
 
 
356 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0579  glycosyl transferase, group 1  57.01 
 
 
357 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199745  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0133  glycosyl transferase, group 1  55.29 
 
 
344 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.865411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0019  glycosyl transferase, group 1  56.97 
 
 
342 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  54.68 
 
 
393 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  54.22 
 
 
333 aa  365  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  55.45 
 
 
355 aa  362  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  53.25 
 
 
394 aa  360  3e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  53.85 
 
 
363 aa  359  5e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  54.98 
 
 
393 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1992  glycosyl transferase group 1  54.6 
 
 
368 aa  358  6e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.984548  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0952  glycosyl transferase group 1  53.66 
 
 
345 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4490  glycosyl transferase group 1  54.82 
 
 
351 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1446  glycosyl transferase, group 1  53.66 
 
 
349 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.131032  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  53.96 
 
 
352 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  54.27 
 
 
352 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4109  glycosyl transferase group 1  52.42 
 
 
355 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719344  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  51.72 
 
 
353 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  55.96 
 
 
350 aa  349  5e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4972  glycosyl transferase group 1  53.51 
 
 
365 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3659  glycosyl transferase, group 1  51.93 
 
 
354 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631125  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  51.14 
 
 
367 aa  345  8e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0114  glycosyl transferase group 1  53.05 
 
 
360 aa  343  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3011  putative glycosyltransferase  49.87 
 
 
380 aa  344  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1909  glycosyl transferase, group 1  54.13 
 
 
351 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0853148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32760  Glycosyl transferase, group 1 protein  54.27 
 
 
353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22600  putative glycosyl transferase  53.21 
 
 
351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.809409  hitchhiker  0.000260588 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2924  glycosyl transferase, group 1  54.6 
 
 
350 aa  335  7e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1312  glycosyl transferase, group 1  52.44 
 
 
349 aa  328  6e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6212  putative glycosyl transferase (group 1)  52.13 
 
 
351 aa  328  8e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0695  glycosyl transferase, group 1  46.96 
 
 
367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  55.42 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  51.5 
 
 
348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  50.74 
 
 
354 aa  325  7e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  50.15 
 
 
355 aa  323  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4943  glycosyl transferase group 1  49.05 
 
 
378 aa  322  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1745  glycosyl transferase group 1  52.89 
 
 
358 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0727463  normal  0.415071 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  47.2 
 
 
345 aa  316  3e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2129  glycosyl transferase group 1  51 
 
 
358 aa  315  7e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1793  glycosyl transferase group 1  51 
 
 
358 aa  315  8e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  50.15 
 
 
345 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2293  glycosyl transferase, group 1  43.64 
 
 
367 aa  242  7.999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  34.36 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  33.52 
 
 
377 aa  192  6e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 
377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
377 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
378 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  32.35 
 
 
382 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  32.61 
 
 
382 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  32.74 
 
 
403 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  32.29 
 
 
382 aa  177  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
376 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  30.94 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.69 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  34.95 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  33.07 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  33.66 
 
 
400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  32.98 
 
 
381 aa  173  5e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
383 aa  173  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  31.81 
 
 
377 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 
406 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
405 aa  170  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
396 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.61 
 
 
380 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 
403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.02 
 
 
380 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  31.02 
 
 
380 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.61 
 
 
380 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  31.52 
 
 
377 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  31.99 
 
 
380 aa  166  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.99 
 
 
380 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
380 aa  165  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>