More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2309 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2294  glycosyl transferase group 1  97.09 
 
 
344 aa  665    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  97.97 
 
 
344 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  99.42 
 
 
344 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
344 aa  699    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  96.22 
 
 
344 aa  657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2271  glycosyl transferase, group 1  97.38 
 
 
344 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693911  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  87.76 
 
 
343 aa  624  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  89.83 
 
 
344 aa  618  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1322  glycosyl transferase group 1  86.59 
 
 
343 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  89.24 
 
 
344 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  89.24 
 
 
344 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  89.24 
 
 
344 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  89.24 
 
 
344 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  89.24 
 
 
344 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  89.24 
 
 
344 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  89.24 
 
 
344 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2028  glycosyl transferase group 1  84.84 
 
 
343 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0125805  normal  0.984429 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1660  diacylglycerol kinase  97.09 
 
 
521 aa  594  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  78.31 
 
 
372 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  78.61 
 
 
350 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2084  hypothetical protein  78.92 
 
 
356 aa  537  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2235  glycosyl transferase group 1  78.01 
 
 
350 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.260131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  75.95 
 
 
375 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  73.11 
 
 
342 aa  523  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  74.24 
 
 
350 aa  509  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1453  hypothetical protein  58.01 
 
 
356 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  53.45 
 
 
333 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  55.15 
 
 
355 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  54.68 
 
 
393 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0579  glycosyl transferase, group 1  52.31 
 
 
357 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199745  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  53.08 
 
 
363 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  54.12 
 
 
350 aa  363  3e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0133  glycosyl transferase, group 1  52.84 
 
 
344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.865411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0019  glycosyl transferase, group 1  55.26 
 
 
342 aa  361  9e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  51.91 
 
 
394 aa  361  1e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1992  glycosyl transferase group 1  55.65 
 
 
368 aa  357  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.984548  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  54.88 
 
 
352 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  55.49 
 
 
352 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  52.56 
 
 
367 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1909  glycosyl transferase, group 1  53.27 
 
 
351 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0853148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4109  glycosyl transferase group 1  52.12 
 
 
355 aa  352  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719344  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0695  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 
367 aa  352  8e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  53.47 
 
 
393 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4490  glycosyl transferase group 1  55.02 
 
 
351 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0952  glycosyl transferase group 1  51.83 
 
 
345 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22600  putative glycosyl transferase  52.98 
 
 
351 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.809409  hitchhiker  0.000260588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6212  putative glycosyl transferase (group 1)  53.1 
 
 
351 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0114  glycosyl transferase group 1  51.22 
 
 
360 aa  344  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  51.5 
 
 
353 aa  342  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3659  glycosyl transferase, group 1  49.7 
 
 
354 aa  342  5.999999999999999e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631125  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3011  putative glycosyltransferase  52.12 
 
 
380 aa  341  8e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1446  glycosyl transferase, group 1  52.44 
 
 
349 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.131032  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4972  glycosyl transferase group 1  51.65 
 
 
365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32760  Glycosyl transferase, group 1 protein  51.83 
 
 
353 aa  334  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1312  glycosyl transferase, group 1  53.66 
 
 
349 aa  332  4e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2924  glycosyl transferase, group 1  53.45 
 
 
350 aa  331  9e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  48.96 
 
 
354 aa  329  6e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  49.24 
 
 
345 aa  328  7e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4943  glycosyl transferase group 1  49.14 
 
 
378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  54.08 
 
 
343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  49.7 
 
 
348 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1745  glycosyl transferase group 1  49.01 
 
 
358 aa  316  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0727463  normal  0.415071 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  47.62 
 
 
355 aa  310  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1793  glycosyl transferase group 1  50.15 
 
 
358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  49.1 
 
 
345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2129  glycosyl transferase group 1  49.85 
 
 
358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2293  glycosyl transferase, group 1  42.48 
 
 
367 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  32.54 
 
 
393 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.87 
 
 
403 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  34.23 
 
 
406 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
377 aa  178  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  31.87 
 
 
377 aa  178  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 
404 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  31.58 
 
 
376 aa  176  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
405 aa  175  9e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  31.59 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
377 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 
378 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  32.1 
 
 
403 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 
396 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
377 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
377 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 
396 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.08 
 
 
380 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.6 
 
 
396 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.54 
 
 
380 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
380 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
380 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  30.89 
 
 
382 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  34.14 
 
 
406 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  30.54 
 
 
380 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.45 
 
 
380 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.08 
 
 
380 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
381 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  30.73 
 
 
382 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  30.62 
 
 
382 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.7 
 
 
380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 
403 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 
381 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>