More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1080 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  709    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2084  hypothetical protein  74 
 
 		 356 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  73.64 
 
 		 350 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  77.58 
 
 		 372 aa  531  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2235  glycosyl transferase group 1  73.07 
 
 		 350 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.260131 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  73.64 
 
 		 342 aa  522  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  74.19 
 
 		 343 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1322  glycosyl transferase group 1  74.19 
 
 		 343 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2028  glycosyl transferase group 1  75.15 
 
 		 343 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0125805  normal  0.984429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  77.58 
 
 		 375 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  75.15 
 
 		 344 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  74.55 
 
 		 344 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  76.36 
 
 		 344 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  74.24 
 
 		 344 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2294  glycosyl transferase group 1  75.15 
 
 		 344 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2271  glycosyl transferase, group 1  75.15 
 
 		 344 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  73.64 
 
 		 344 aa  495  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  73.64 
 
 		 344 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  73.64 
 
 		 344 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  73.64 
 
 		 344 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  73.64 
 
 		 344 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  73.64 
 
 		 344 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  73.64 
 
 		 344 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  73.64 
 
 		 344 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1660  diacylglycerol kinase  75.4 
 
 		 521 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1453  hypothetical protein  59.88 
 
 		 356 aa  408  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1992  glycosyl transferase group 1  57.74 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.984548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  54.55 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0579  glycosyl transferase, group 1  51.9 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199745  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0019  glycosyl transferase, group 1  56.47 
 
 		 342 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0133  glycosyl transferase, group 1  54.24 
 
 		 344 aa  364  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.865411  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  53.55 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4109  glycosyl transferase group 1  53.64 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  53.85 
 
 		 363 aa  359  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0952  glycosyl transferase group 1  52.11 
 
 		 345 aa  360  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  52.96 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  52.24 
 
 		 393 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  52.45 
 
 		 353 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3659  glycosyl transferase, group 1  50.29 
 
 		 354 aa  354  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  52.82 
 
 		 367 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  54.27 
 
 		 352 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0114  glycosyl transferase group 1  52.6 
 
 		 360 aa  352  7e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  56.57 
 
 		 350 aa  352  8e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  53.96 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6212  putative glycosyl transferase (group 1)  53.66 
 
 		 351 aa  349  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3011  putative glycosyltransferase  52.87 
 
 		 380 aa  349  4e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1909  glycosyl transferase, group 1  53.99 
 
 		 351 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0853148  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  52.54 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1446  glycosyl transferase, group 1  51.32 
 
 		 349 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.131032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4490  glycosyl transferase group 1  53.55 
 
 		 351 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22600  putative glycosyl transferase  53.07 
 
 		 351 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.809409  hitchhiker  0.000260588 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0695  glycosyl transferase, group 1  48.44 
 
 		 367 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32760  Glycosyl transferase, group 1 protein  52.74 
 
 		 353 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4972  glycosyl transferase group 1  52.24 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2924  glycosyl transferase, group 1  53.37 
 
 		 350 aa  335  5e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1312  glycosyl transferase, group 1  52.74 
 
 		 349 aa  332  8e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  51.9 
 
 		 348 aa  331  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  49.85 
 
 		 345 aa  330  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  49.15 
 
 		 354 aa  327  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  48.63 
 
 		 355 aa  324  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  54.52 
 
 		 343 aa  323  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  50.31 
 
 		 345 aa  316  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1745  glycosyl transferase group 1  50.45 
 
 		 358 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0727463  normal  0.415071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4943  glycosyl transferase group 1  49.85 
 
 		 378 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1793  glycosyl transferase group 1  49.72 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2129  glycosyl transferase group 1  49.44 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2293  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  35.26 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 		 404 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.55 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  35.6 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  35.6 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 		 381 aa  179  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 		 405 aa  179  9e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.22 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 		 376 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  35.63 
 
 		 378 aa  172  9e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  34.99 
 
 		 381 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  31.62 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  31.62 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  33.24 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  31.02 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  31.62 
 
 		 377 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  31.72 
 
 		 377 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 		 377 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  31.54 
 
 		 377 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  29.55 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.37 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 		 406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>