More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1174 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 403 aa  827    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  87.93 
 
 		 406 aa  741    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  74.56 
 
 		 406 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.94 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  74.03 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  71.28 
 
 		 404 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  75.34 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  71.47 
 
 		 403 aa  563  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  65.31 
 
 		 406 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  67.11 
 
 		 406 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  68.1 
 
 		 400 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 		 432 aa  363  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  51.18 
 
 		 413 aa  349  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  49.47 
 
 		 403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  49.1 
 
 		 416 aa  336  5e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  51.51 
 
 		 408 aa  331  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  46.38 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  46.59 
 
 		 378 aa  325  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  46.17 
 
 		 381 aa  322  7e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  44.07 
 
 		 405 aa  315  9e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  43.27 
 
 		 655 aa  312  4.999999999999999e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  46.17 
 
 		 385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  46.51 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  46.51 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  41.25 
 
 		 441 aa  276  4e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  45.91 
 
 		 398 aa  272  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  39.89 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  42.04 
 
 		 378 aa  252  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.04 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  38.65 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 383 aa  236  8e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.73 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  36.87 
 
 		 381 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 		 380 aa  219  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.28 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.54 
 
 		 380 aa  217  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.8 
 
 		 380 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.79 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  32.79 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  34.64 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.28 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  34.4 
 
 		 387 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  31.95 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  39.02 
 
 		 416 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 		 377 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 		 377 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 		 377 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 		 376 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  36.77 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  34.29 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 387 aa  199  7e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  31.91 
 
 		 377 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 		 810 aa  196  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  33.6 
 
 		 385 aa  194  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  31.96 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 772 aa  193  5e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  31.84 
 
 		 377 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  32.11 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  32.11 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  32.55 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  31.81 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 		 420 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  31.12 
 
 		 373 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 		 390 aa  186  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 381 aa  186  8e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  34.56 
 
 		 373 aa  186  8e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  30.85 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  32.2 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  32.55 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 		 394 aa  183  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  39.87 
 
 		 343 aa  183  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 363 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 353 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  34.77 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  31.81 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.46 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 		 816 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 		 344 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 		 342 aa  180  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 		 344 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  33.41 
 
 		 871 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.86 
 
 		 344 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.86 
 
 		 344 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.86 
 
 		 344 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.86 
 
 		 344 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 		 344 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.86 
 
 		 344 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.86 
 
 		 344 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.86 
 
 		 344 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  34.22 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  36.22 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 		 354 aa  176  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 		 344 aa  176  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2271  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>