More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0048 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  80.63 
 
 		 382 aa  652    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  80.89 
 
 		 382 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  100 
 
 		 382 aa  778    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  91.08 
 
 		 381 aa  710    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  86.93 
 
 		 381 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  80.63 
 
 		 382 aa  651    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  74.67 
 
 		 377 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  74.13 
 
 		 377 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  74.39 
 
 		 373 aa  591  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  74.4 
 
 		 377 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  66.49 
 
 		 377 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  66.49 
 
 		 377 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  67.8 
 
 		 377 aa  515  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  67.56 
 
 		 378 aa  507  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  65.45 
 
 		 377 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  65.68 
 
 		 376 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  65.68 
 
 		 385 aa  499  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  61.52 
 
 		 377 aa  491  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  51.05 
 
 		 385 aa  391  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  44.99 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  47.62 
 
 		 374 aa  315  8e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  44.44 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  47.87 
 
 		 372 aa  305  7e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  43.16 
 
 		 381 aa  302  6.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  42.06 
 
 		 377 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  42.09 
 
 		 381 aa  285  7e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  41.38 
 
 		 507 aa  280  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  39.16 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43286  predicted protein  38.98 
 
 		 456 aa  259  7e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  normal  0.0628635 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43238  predicted protein  38.98 
 
 		 456 aa  259  7e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169779  normal  0.020707 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.53 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.7 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  35.7 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.17 
 
 		 380 aa  252  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.7 
 
 		 380 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.43 
 
 		 380 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.17 
 
 		 380 aa  249  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 		 381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  38.11 
 
 		 387 aa  236  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  36.55 
 
 		 381 aa  235  8e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  38.56 
 
 		 373 aa  229  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  33.42 
 
 		 376 aa  222  8e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  35.7 
 
 		 426 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 420 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 		 385 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  34.3 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07870  glycosyltransferase  35.42 
 
 		 391 aa  211  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  34.7 
 
 		 405 aa  210  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 		 378 aa  210  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  37.53 
 
 		 416 aa  209  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 379 aa  202  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 		 434 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 		 375 aa  199  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2239  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 		 458 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  33.85 
 
 		 373 aa  195  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  36.53 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  33.12 
 
 		 372 aa  192  7e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  34.29 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.11 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 		 406 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  34.75 
 
 		 396 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  33.33 
 
 		 378 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 		 393 aa  189  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1095  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 		 383 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  33.77 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.2 
 
 		 403 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 393 aa  183  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0755  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 		 375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0761  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0775  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 		 432 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  35.31 
 
 		 398 aa  179  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 		 403 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 378 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.76 
 
 		 373 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 		 404 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  32.29 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 		 416 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 		 406 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 		 812 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 381 aa  169  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2235  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 		 350 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.260131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 		 350 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>