More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1907 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 426 aa  836    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2239  glycosyl transferase group 1  76.14 
 
 		 458 aa  568  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  52.56 
 
 		 420 aa  356  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  52.13 
 
 		 427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  50.81 
 
 		 393 aa  332  8e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  50.27 
 
 		 378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  49.11 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  50.79 
 
 		 405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  48.66 
 
 		 375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  47.85 
 
 		 385 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  51.47 
 
 		 373 aa  312  6.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  53.32 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0761  glycosyl transferase, group 1  51.34 
 
 		 376 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0775  glycosyl transferase, group 1  51.34 
 
 		 376 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0755  glycosyl transferase, group 1  51.08 
 
 		 375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  48.12 
 
 		 375 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  46.44 
 
 		 384 aa  292  8e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07870  glycosyltransferase  43.46 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1095  glycosyl transferase group 1  47.47 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  44.97 
 
 		 381 aa  284  3.0000000000000004e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  44.05 
 
 		 377 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  43.47 
 
 		 381 aa  276  7e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  43.73 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 		 376 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  35.86 
 
 		 382 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  36.13 
 
 		 381 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  34.04 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  34.82 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  35.17 
 
 		 382 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  35.68 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  35.79 
 
 		 385 aa  225  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 		 385 aa  224  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  36.77 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  35.43 
 
 		 381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  33.6 
 
 		 377 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  32.63 
 
 		 377 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  32.81 
 
 		 377 aa  219  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  32.71 
 
 		 373 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  35.09 
 
 		 377 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  35.39 
 
 		 387 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  34.23 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  39.37 
 
 		 374 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.89 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.63 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.4 
 
 		 380 aa  195  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 		 416 aa  193  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.37 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.1 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  29.1 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.37 
 
 		 380 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  34.21 
 
 		 406 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  34.47 
 
 		 406 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  29.52 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 		 378 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.96 
 
 		 373 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  33.95 
 
 		 396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 		 406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.5 
 
 		 396 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 383 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 		 404 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43238  predicted protein  34.32 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169779  normal  0.020707 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43286  predicted protein  34.32 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  normal  0.0628635 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 		 403 aa  177  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 		 396 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.19 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  33.41 
 
 		 400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 		 373 aa  173  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  32.74 
 
 		 393 aa  173  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 		 413 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 381 aa  169  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  27.58 
 
 		 379 aa  167  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  35.56 
 
 		 372 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  27.51 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 655 aa  164  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 		 393 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 		 507 aa  162  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 		 390 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 		 390 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 378 aa  159  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  35.57 
 
 		 378 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 		 398 aa  157  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 		 432 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  35.24 
 
 		 408 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3550  glycosyl transferase, group 1  38.5 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>