More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3550 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3550  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
389 aa  755    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
420 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  38.62 
 
 
375 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  40.91 
 
 
427 aa  193  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0755  glycosyl transferase, group 1  39.15 
 
 
375 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  35.28 
 
 
384 aa  180  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0761  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 
376 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0775  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 
376 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193821  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 
375 aa  179  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
393 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  35.13 
 
 
385 aa  176  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  37.3 
 
 
373 aa  176  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  36.76 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  38.44 
 
 
426 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2239  glycosyl transferase group 1  39.47 
 
 
458 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  35.28 
 
 
434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1095  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 
383 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
376 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  34.14 
 
 
377 aa  158  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  33.7 
 
 
381 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  32.12 
 
 
382 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07870  glycosyltransferase  33.25 
 
 
391 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  32.69 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  30.65 
 
 
377 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
377 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
377 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  30.11 
 
 
377 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
377 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  30.38 
 
 
377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  32.5 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  33.75 
 
 
381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
377 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  33.42 
 
 
405 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  29.89 
 
 
382 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  37.15 
 
 
374 aa  143  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
381 aa  142  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  29.35 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  39.08 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
381 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  30.79 
 
 
382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  29.82 
 
 
381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
387 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
507 aa  123  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
383 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
393 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  29.16 
 
 
372 aa  112  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43286  predicted protein  27.73 
 
 
456 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  normal  0.0628635 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43238  predicted protein  27.73 
 
 
456 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169779  normal  0.020707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
387 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  21.73 
 
 
381 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.6 
 
 
380 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
385 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.4 
 
 
380 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
381 aa  99  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 
409 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
387 aa  99.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.33 
 
 
380 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  21.87 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.6 
 
 
380 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  21.6 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 
390 aa  97.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
416 aa  96.7  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
401 aa  96.3  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
406 aa  96.3  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
406 aa  96.3  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 
379 aa  96.3  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.34 
 
 
380 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  22.34 
 
 
380 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3802  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.769025  normal  0.0224743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.33 
 
 
380 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  25.13 
 
 
372 aa  95.1  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 
378 aa  94  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3803  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
406 aa  93.2  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.551552 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 
354 aa  92.8  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
381 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
416 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 
432 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 
385 aa  91.3  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 
373 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 
394 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 
390 aa  89.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  27.66 
 
 
406 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 
390 aa  89.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
655 aa  89.4  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
406 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
345 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  26.49 
 
 
406 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.32 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  26.54 
 
 
803 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32760  Glycosyl transferase, group 1 protein  29.53 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
871 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0579  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199745  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.08 
 
 
400 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>