More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2157 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
385 aa  790    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  67.02 
 
 
401 aa  528  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  62.47 
 
 
393 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  47.58 
 
 
416 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3802  glycosyl transferase, group 1  45.7 
 
 
394 aa  318  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.769025  normal  0.0224743 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
390 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  35.57 
 
 
376 aa  218  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
378 aa  217  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
381 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  34.05 
 
 
372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
387 aa  212  7.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42467  predicted protein  32.99 
 
 
679 aa  196  8.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
377 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.37 
 
 
380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  31.62 
 
 
393 aa  182  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
381 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
380 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.51 
 
 
380 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
655 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.63 
 
 
380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
380 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.63 
 
 
380 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  27.63 
 
 
380 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
403 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.84 
 
 
380 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.63 
 
 
380 aa  176  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
387 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
383 aa  171  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 
373 aa  169  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
416 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  30.53 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 
400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 
404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  32.05 
 
 
406 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 
381 aa  162  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  32.43 
 
 
406 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
403 aa  160  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37583  predicted protein  32.17 
 
 
400 aa  159  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17568  hitchhiker  0.00128126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
420 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  32.55 
 
 
396 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
434 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.55 
 
 
396 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  32.82 
 
 
405 aa  157  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
396 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 
390 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 
390 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  27.39 
 
 
382 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  29.84 
 
 
382 aa  155  8e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
378 aa  155  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
405 aa  155  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  27.39 
 
 
382 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
385 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
432 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.87 
 
 
373 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  28.76 
 
 
382 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
377 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
385 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  28.8 
 
 
381 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1095  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
413 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  29.35 
 
 
381 aa  146  5e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
384 aa  146  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 
406 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
376 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 
426 aa  145  9e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
378 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
387 aa  144  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  29.14 
 
 
377 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  25.59 
 
 
377 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
381 aa  142  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.03 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
377 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  27.6 
 
 
385 aa  140  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  29.3 
 
 
378 aa  139  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  27.73 
 
 
377 aa  138  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 
333 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  28.83 
 
 
377 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  31.66 
 
 
375 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
354 aa  136  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  25.07 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 
507 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
389 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
390 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
427 aa  133  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
743 aa  133  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
398 aa  132  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3803  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.551552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2239  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
458 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
402 aa  130  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>