More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3543 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
373 aa  750    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  53.44 
 
 
416 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  51.21 
 
 
403 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  50 
 
 
403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  58.97 
 
 
408 aa  355  6.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  49.87 
 
 
400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  49.6 
 
 
406 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  49.33 
 
 
406 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
381 aa  349  4e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  50.93 
 
 
413 aa  346  4e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.8 
 
 
396 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  46.79 
 
 
406 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  49.07 
 
 
396 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.38 
 
 
403 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  48.53 
 
 
396 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  48.27 
 
 
404 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  47.66 
 
 
378 aa  332  6e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  47.54 
 
 
385 aa  326  3e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  50.82 
 
 
390 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  50.82 
 
 
390 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  46.88 
 
 
406 aa  319  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  45.92 
 
 
655 aa  315  8e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  45.04 
 
 
432 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  47.99 
 
 
398 aa  301  9e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  43.2 
 
 
405 aa  299  5e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  40.1 
 
 
441 aa  280  4e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  39.52 
 
 
378 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.84 
 
 
373 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  37.6 
 
 
393 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  38.65 
 
 
381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  38.67 
 
 
381 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 
377 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.55 
 
 
380 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
376 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
380 aa  205  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.82 
 
 
380 aa  205  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.55 
 
 
380 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
381 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.82 
 
 
380 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  33.85 
 
 
381 aa  204  3e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  31.75 
 
 
382 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  31.5 
 
 
382 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  33.86 
 
 
381 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  33.85 
 
 
382 aa  202  6e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.28 
 
 
380 aa  202  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.55 
 
 
380 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  31.55 
 
 
380 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  33.89 
 
 
382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  33.95 
 
 
377 aa  199  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  33.43 
 
 
377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
377 aa  195  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
377 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  33.95 
 
 
381 aa  194  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  39.38 
 
 
374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 
387 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  29.89 
 
 
377 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  31.18 
 
 
385 aa  189  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  29.89 
 
 
377 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  36.58 
 
 
385 aa  189  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 
377 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 
377 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  29.84 
 
 
373 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  37.01 
 
 
354 aa  186  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 
416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
378 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 
333 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  35.24 
 
 
363 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  32.38 
 
 
405 aa  180  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 
387 aa  180  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  35.03 
 
 
803 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  35.35 
 
 
355 aa  179  9e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  35.91 
 
 
345 aa  178  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  29.02 
 
 
376 aa  177  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 
426 aa  175  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  34.63 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  38.87 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
381 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
420 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  32.53 
 
 
355 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 
385 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
393 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  34.7 
 
 
350 aa  169  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
427 aa  169  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  37.11 
 
 
350 aa  169  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  35.99 
 
 
352 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  39.02 
 
 
348 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 
401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  30.75 
 
 
372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  35.28 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 
434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6212  putative glycosyl transferase (group 1)  32.97 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>