More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1142 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
378 aa  765    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
373 aa  755    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  45.01 
 
 
403 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  48.06 
 
 
400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  44.22 
 
 
403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  42.82 
 
 
413 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  48.08 
 
 
396 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  45.82 
 
 
396 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  47.79 
 
 
396 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  43.08 
 
 
406 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  47.37 
 
 
416 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  47.09 
 
 
406 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  44.72 
 
 
406 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  42.47 
 
 
381 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  42.93 
 
 
404 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  46.48 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  42.7 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  42.7 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.04 
 
 
403 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  45.07 
 
 
406 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  41.11 
 
 
378 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  38.7 
 
 
655 aa  247  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  41.24 
 
 
432 aa  245  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  40.32 
 
 
393 aa  245  9e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  41.04 
 
 
441 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  43.02 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  41.49 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  41.91 
 
 
381 aa  243  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  40.89 
 
 
377 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  41.43 
 
 
398 aa  232  7.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  38.74 
 
 
405 aa  232  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  37.19 
 
 
381 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  39.52 
 
 
373 aa  229  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
383 aa  226  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.9 
 
 
380 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.29 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.17 
 
 
380 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.37 
 
 
380 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.57 
 
 
380 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  34.57 
 
 
380 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  35.37 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.03 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  36.8 
 
 
387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  32.81 
 
 
382 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 
385 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  32.81 
 
 
382 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
376 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
377 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1095  glycosyl transferase group 1  35.88 
 
 
383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
377 aa  189  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  32.45 
 
 
382 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
820 aa  186  7e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  35.17 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  32.45 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  30.42 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
377 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  29.89 
 
 
377 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
427 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 
363 aa  179  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  36.44 
 
 
354 aa  179  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 
378 aa  179  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  38.87 
 
 
405 aa  178  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  34.12 
 
 
381 aa  178  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  36.58 
 
 
416 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  31.76 
 
 
382 aa  178  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  38.29 
 
 
353 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  30.16 
 
 
377 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  33.16 
 
 
377 aa  178  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  29.95 
 
 
373 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  35.88 
 
 
426 aa  176  8e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  31.94 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 
375 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  35.85 
 
 
803 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 
393 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 
387 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
379 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
772 aa  169  7e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  32.89 
 
 
378 aa  169  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 
387 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 
345 aa  168  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  33.43 
 
 
394 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  38.58 
 
 
373 aa  167  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
393 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4972  glycosyl transferase group 1  39.17 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
333 aa  164  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  31.68 
 
 
381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0579  glycosyl transferase, group 1  34.45 
 
 
357 aa  163  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
384 aa  162  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  35.99 
 
 
352 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
819 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4109  glycosyl transferase group 1  37.97 
 
 
355 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719344  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 
812 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  35.03 
 
 
352 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  37.97 
 
 
348 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  34.85 
 
 
393 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>