More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1480 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  62.41 
 
 
812 aa  1025    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  100 
 
 
803 aa  1653    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  60.83 
 
 
819 aa  999    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  40.51 
 
 
820 aa  602  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  40.53 
 
 
816 aa  569  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  41.99 
 
 
827 aa  568  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  39.39 
 
 
816 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  40.66 
 
 
803 aa  545  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  37.41 
 
 
871 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  35.72 
 
 
810 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
772 aa  432  1e-119  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
383 aa  211  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.88 
 
 
380 aa  198  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  36.69 
 
 
393 aa  198  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.88 
 
 
380 aa  197  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.61 
 
 
380 aa  196  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.88 
 
 
380 aa  195  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
380 aa  195  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  31.88 
 
 
380 aa  195  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.61 
 
 
380 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 
380 aa  194  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.61 
 
 
380 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
381 aa  191  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1603  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
381 aa  181  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 
432 aa  174  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  34.49 
 
 
373 aa  172  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  33.15 
 
 
377 aa  172  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
377 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  35.65 
 
 
387 aa  172  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 
378 aa  171  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 
396 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.85 
 
 
373 aa  171  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.64 
 
 
396 aa  171  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  33.16 
 
 
406 aa  171  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
381 aa  170  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  34.79 
 
 
381 aa  170  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  33.88 
 
 
382 aa  170  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
376 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  33.97 
 
 
406 aa  170  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  35.28 
 
 
381 aa  170  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  34.71 
 
 
382 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
381 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 
416 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  34.53 
 
 
400 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
377 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  33.8 
 
 
403 aa  166  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
377 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
406 aa  164  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  30.47 
 
 
376 aa  164  9e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
404 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
377 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
390 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 
377 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  33.72 
 
 
381 aa  159  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
396 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  33.81 
 
 
378 aa  158  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  33.33 
 
 
382 aa  158  4e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  32.9 
 
 
381 aa  158  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  32.97 
 
 
377 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  31.42 
 
 
377 aa  157  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
403 aa  157  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
655 aa  156  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 
413 aa  156  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  32.7 
 
 
377 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.72 
 
 
403 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  33.64 
 
 
385 aa  154  7e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 
378 aa  154  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 
405 aa  152  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
387 aa  152  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  31.5 
 
 
382 aa  151  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
363 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
385 aa  151  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
416 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  33.24 
 
 
372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  31.87 
 
 
373 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
385 aa  149  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 
393 aa  149  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 
406 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
379 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
420 aa  145  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
378 aa  143  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 
393 aa  142  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  30.1 
 
 
377 aa  141  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42467  predicted protein  30.05 
 
 
679 aa  140  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
406 aa  140  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
406 aa  140  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 
352 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
408 aa  140  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 
507 aa  140  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  34.17 
 
 
372 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
374 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  33.61 
 
 
350 aa  138  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2235  glycosyl transferase group 1  33.61 
 
 
350 aa  137  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.260131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  33.98 
 
 
375 aa  137  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0579  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 
357 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199745  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
344 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 
344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
390 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>