More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2903 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  47.31 
 
 
871 aa  778    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  49.2 
 
 
816 aa  790    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  49.2 
 
 
803 aa  769    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  50.74 
 
 
820 aa  808    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  50.49 
 
 
816 aa  810    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
827 aa  1709    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  43.02 
 
 
812 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  42.23 
 
 
819 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  41.99 
 
 
803 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 
810 aa  420  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 
772 aa  419  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.91 
 
 
380 aa  212  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.85 
 
 
380 aa  209  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  34.85 
 
 
380 aa  209  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.76 
 
 
380 aa  208  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.9 
 
 
380 aa  208  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
380 aa  208  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
380 aa  207  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
383 aa  207  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.27 
 
 
380 aa  207  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.76 
 
 
380 aa  206  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
381 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  34.62 
 
 
393 aa  191  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  35.49 
 
 
387 aa  184  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1603  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 
381 aa  180  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  32.6 
 
 
376 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  31.99 
 
 
406 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.99 
 
 
403 aa  173  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  31.66 
 
 
406 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 
381 aa  171  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  31.66 
 
 
406 aa  170  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
403 aa  170  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
378 aa  169  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
403 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
390 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  32.15 
 
 
377 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
416 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
381 aa  165  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
377 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  35.89 
 
 
381 aa  164  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.21 
 
 
396 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.03 
 
 
373 aa  162  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
376 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 
378 aa  162  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 
400 aa  162  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  32.21 
 
 
396 aa  161  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
387 aa  160  8e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
381 aa  160  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  31.05 
 
 
372 aa  159  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
396 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 
385 aa  159  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  31.04 
 
 
377 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  31.52 
 
 
377 aa  158  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  31.04 
 
 
377 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 
404 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  32.25 
 
 
377 aa  157  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
507 aa  157  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 
390 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 
390 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  30.6 
 
 
377 aa  155  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  33.93 
 
 
382 aa  154  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
379 aa  154  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  32.29 
 
 
382 aa  153  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  32.55 
 
 
381 aa  153  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  32.29 
 
 
382 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  31.84 
 
 
378 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  30.47 
 
 
373 aa  151  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 
432 aa  150  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  31.89 
 
 
381 aa  150  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
406 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  32.26 
 
 
382 aa  149  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
413 aa  149  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
405 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 
416 aa  148  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
378 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  32.13 
 
 
385 aa  146  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  31.13 
 
 
377 aa  146  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
377 aa  145  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42467  predicted protein  29.02 
 
 
679 aa  144  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
373 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
406 aa  140  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 
350 aa  140  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
406 aa  140  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
420 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  30.35 
 
 
387 aa  134  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  30 
 
 
378 aa  134  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 
427 aa  134  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
393 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 
441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1446  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 
349 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.131032  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 
348 aa  132  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
393 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
655 aa  131  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  33.43 
 
 
374 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  31.17 
 
 
355 aa  130  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
354 aa  130  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
342 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 
408 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>