More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1603 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1603  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 381 aa  793    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  37.76 
 
 		 820 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 		 816 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  31.96 
 
 		 803 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 		 772 aa  173  3.9999999999999995e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 810 aa  172  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 		 819 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 		 827 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 		 812 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 871 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 803 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  29.16 
 
 		 393 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  29.95 
 
 		 816 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.88 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  29.47 
 
 		 406 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 		 396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  29.47 
 
 		 406 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 		 400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  28.81 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.67 
 
 		 403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 387 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 		 403 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  28.03 
 
 		 381 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0952  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.25 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0114  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  28.48 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 381 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  25.25 
 
 		 377 aa  116  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4972  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 		 365 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.53 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  27.25 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  29.18 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 		 352 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  25.99 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 381 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 381 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.25 
 
 		 380 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 376 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  27.25 
 
 		 380 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  26.34 
 
 		 381 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.97 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1453  hypothetical protein  28.16 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4109  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.69 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4490  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.69 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  26.28 
 
 		 372 aa  110  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  27.85 
 
 		 377 aa  110  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 377 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  26.6 
 
 		 382 aa  109  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1446  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 349 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.131032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 420 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 377 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  28.88 
 
 		 385 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0133  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.865411  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  24.67 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1010  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156875  hitchhiker  0.0000000000138079 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.97 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  26.18 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1312  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 378 aa  107  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.41 
 
 		 377 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 373 aa  106  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>