More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1010 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  89.46 
 
 		 373 aa  678    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4444  glycosyl transferase group 1  90 
 
 		 373 aa  680    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0794772  hitchhiker  0.000041841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1010  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 370 aa  757    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156875  hitchhiker  0.0000000000138079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4353  glycosyl transferase, group 1  89.73 
 
 		 373 aa  678    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.144729  normal  0.010377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  75.48 
 
 		 370 aa  550  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4878  hypothetical protein  72.58 
 
 		 371 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56030  hypothetical protein  72.58 
 
 		 371 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17910  Glycosyl transferase, group 1 family protein  66.29 
 
 		 366 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1224  glycosyl transferase, group 1  60.06 
 
 		 372 aa  431  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3920  glycosyl transferase, group 1  52.94 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2839  glycosyl transferase group 1  42.31 
 
 		 410 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000929043  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3883  glycosyl transferase group 1  43.17 
 
 		 399 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3771  glycosyl transferase group 1  43.17 
 
 		 390 aa  249  7e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.607496  normal  0.0472047 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1145  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0698  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 378 aa  149  9e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1814  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 		 381 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  33.7 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 401 aa  119  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5824  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 411 aa  119  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 381 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.82 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 		 380 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 		 416 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.95 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.42 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  23.42 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  28.15 
 
 		 372 aa  113  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.95 
 
 		 380 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.42 
 
 		 380 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 		 385 aa  113  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  23.42 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1973  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.16 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11940  glycosyltransferase  29.26 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0997293  normal  0.0817193 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 655 aa  110  4.0000000000000004e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3310  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  25.66 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  29.14 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1603  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 		 403 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 810 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 		 507 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  30.23 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 426 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.5 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  30.35 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 378 aa  103  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 		 381 aa  102  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 		 375 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  27.93 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  28.75 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  23.54 
 
 		 382 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  27.93 
 
 		 377 aa  100  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 		 379 aa  99.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  24.67 
 
 		 382 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 		 368 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  24.47 
 
 		 377 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  25.84 
 
 		 381 aa  99.4  9e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3285  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 387 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  29.26 
 
 		 803 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.69 
 
 		 400 aa  96.7  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 		 827 aa  96.7  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 		 406 aa  96.3  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 390 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 390 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  23.82 
 
 		 406 aa  96.3  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42467  predicted protein  28.96 
 
 		 679 aa  96.3  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.06 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2239  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 		 458 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  23.28 
 
 		 381 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>