More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4444 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  94.91 
 
 		 373 aa  727    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4444  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 373 aa  763    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0794772  hitchhiker  0.000041841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4353  glycosyl transferase, group 1  94.37 
 
 		 373 aa  722    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.144729  normal  0.010377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1010  glycosyl transferase group 1  90 
 
 		 370 aa  680    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156875  hitchhiker  0.0000000000138079 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  76.86 
 
 		 370 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4878  hypothetical protein  72.85 
 
 		 371 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56030  hypothetical protein  72.58 
 
 		 371 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17910  Glycosyl transferase, group 1 family protein  66.01 
 
 		 366 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1224  glycosyl transferase, group 1  58.4 
 
 		 372 aa  425  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3920  glycosyl transferase, group 1  53.22 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2839  glycosyl transferase group 1  42.03 
 
 		 410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000929043  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3771  glycosyl transferase group 1  44.54 
 
 		 390 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.607496  normal  0.0472047 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3883  glycosyl transferase group 1  44.54 
 
 		 399 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1145  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 373 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0698  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 378 aa  152  7e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.35 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 381 aa  126  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 		 380 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.59 
 
 		 380 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  25.59 
 
 		 380 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.26 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1814  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.59 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  33.2 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.26 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.25 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 		 393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 427 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5824  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3310  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 		 393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 		 385 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  31.88 
 
 		 381 aa  113  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  29.69 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 810 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11940  glycosyltransferase  29.97 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0997293  normal  0.0817193 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  26.19 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1973  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  25.4 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  26.05 
 
 		 377 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 		 507 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  25.4 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.85 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 		 403 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 		 426 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 		 385 aa  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3285  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  28.23 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.48 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 655 aa  101  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 385 aa  99.8  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 		 820 aa  99.8  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  29.72 
 
 		 378 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  26.56 
 
 		 372 aa  99.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  32.02 
 
 		 803 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2239  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 458 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 		 385 aa  96.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  29.25 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 		 390 aa  96.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  24.6 
 
 		 381 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 441 aa  96.7  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 390 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 387 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 390 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07870  glycosyltransferase  29.18 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  24 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>