More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3285 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3285  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
395 aa  778    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3310  glycosyl transferase, group 1  44.95 
 
 
368 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  45.07 
 
 
388 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  45.07 
 
 
388 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  45.07 
 
 
388 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  44.62 
 
 
368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1973  glycosyl transferase group 1  42.93 
 
 
370 aa  250  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0659  glycosyl transferase, group 1  46.81 
 
 
370 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  44.04 
 
 
381 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11940  glycosyltransferase  41.22 
 
 
367 aa  234  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0997293  normal  0.0817193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3525  glycosyl transferase group 1  45.32 
 
 
417 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1906  glycosyl transferase, group 1  42.44 
 
 
394 aa  202  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2238  glycosyl transferase group 1  40.62 
 
 
398 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38483  normal  0.0177268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 
370 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.51 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4878  hypothetical protein  30.6 
 
 
371 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4353  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.144729  normal  0.010377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56030  hypothetical protein  30.35 
 
 
371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17910  Glycosyl transferase, group 1 family protein  31.69 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4444  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0794772  hitchhiker  0.000041841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1010  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156875  hitchhiker  0.0000000000138079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1224  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
372 aa  103  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1814  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
391 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3920  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
372 aa  97.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2839  glycosyl transferase group 1  31.04 
 
 
410 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000929043  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  25.5 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  25.5 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  25.99 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32760  Glycosyl transferase, group 1 protein  30.45 
 
 
353 aa  92.8  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
416 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  27.84 
 
 
381 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
383 aa  90.1  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0698  glycosyl transferase group 1  19.4 
 
 
378 aa  89.7  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
378 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0133  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
344 aa  87.4  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.865411  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  26.49 
 
 
381 aa  86.3  8e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  28.17 
 
 
367 aa  86.3  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
344 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  27.82 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1322  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  27.72 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
344 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
345 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 
394 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2028  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0125805  normal  0.984429 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  24.04 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  26.29 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  26.39 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0654  glycosyltransferase  29.84 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.385446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3011  putative glycosyltransferase  28.95 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.75 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  23.26 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  24.47 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  36.93 
 
 
816 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
871 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2581  glycosyl transferase, group 1  23.9 
 
 
421 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170764  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.22 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22600  putative glycosyl transferase  27.39 
 
 
351 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.809409  hitchhiker  0.000260588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1909  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0853148  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  25.24 
 
 
373 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
381 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.25 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
820 aa  77  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  28.18 
 
 
350 aa  77  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3883  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
399 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
385 aa  77  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3771  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
390 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.607496  normal  0.0472047 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
743 aa  77  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.04 
 
 
404 aa  77  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 
819 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
404 aa  77  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  23.62 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.48 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.48 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.48 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.48 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.48 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.48 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.48 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>