More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1973 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1973  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
370 aa  736    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3310  glycosyl transferase, group 1  55.59 
 
 
368 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  54.7 
 
 
368 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  55.52 
 
 
388 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  55.52 
 
 
388 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  55.52 
 
 
388 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  54.55 
 
 
381 aa  363  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3525  glycosyl transferase group 1  50.66 
 
 
417 aa  305  9.000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1906  glycosyl transferase, group 1  47.47 
 
 
394 aa  250  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11940  glycosyltransferase  42.44 
 
 
367 aa  249  4e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0997293  normal  0.0817193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2238  glycosyl transferase group 1  46.81 
 
 
398 aa  243  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38483  normal  0.0177268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3285  glycosyl transferase group 1  42.93 
 
 
395 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0659  glycosyl transferase, group 1  40.8 
 
 
370 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4878  hypothetical protein  32.53 
 
 
371 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56030  hypothetical protein  32.53 
 
 
371 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  26.7 
 
 
382 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  26.18 
 
 
382 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1010  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156875  hitchhiker  0.0000000000138079 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  27.11 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  28.53 
 
 
381 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17910  Glycosyl transferase, group 1 family protein  31.2 
 
 
366 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4444  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
373 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0794772  hitchhiker  0.000041841 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  28.8 
 
 
382 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  25.4 
 
 
382 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.91 
 
 
373 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4353  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
373 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.144729  normal  0.010377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 
370 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3920  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
372 aa  99.8  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2839  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
410 aa  96.3  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000929043  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1224  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
372 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0698  glycosyl transferase group 1  22.15 
 
 
378 aa  92.8  8e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  23.38 
 
 
377 aa  92.8  8e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 
383 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  23.44 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  23.83 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
376 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  24.58 
 
 
373 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  27.66 
 
 
377 aa  89  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1145  glycosyl transferase group 1  21.36 
 
 
373 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 
377 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
378 aa  86.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 
446 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  37.63 
 
 
367 aa  84  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0701  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1814  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 
507 aa  79.7  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  27.35 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
403 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  35.59 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  35.63 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.46 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  21.9 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3771  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.607496  normal  0.0472047 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3883  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  35.38 
 
 
803 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  22.87 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.9 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
380 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  23.48 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  20.06 
 
 
388 aa  72  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  35.03 
 
 
379 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  23.34 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
452 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43286  predicted protein  29.91 
 
 
456 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  normal  0.0628635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43238  predicted protein  29.91 
 
 
456 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169779  normal  0.020707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  31.22 
 
 
421 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.5 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2581  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 
421 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170764  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  19.41 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  29.5 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  28.21 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>