More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1906 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1906  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 394 aa  753    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2238  glycosyl transferase group 1  73.07 
 
 		 398 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38483  normal  0.0177268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1973  glycosyl transferase group 1  47.61 
 
 		 370 aa  294  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3310  glycosyl transferase, group 1  49.33 
 
 		 368 aa  286  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  46.76 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  46.77 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  46.77 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  46.77 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  48.68 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0659  glycosyl transferase, group 1  44.09 
 
 		 370 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11940  glycosyltransferase  41.62 
 
 		 367 aa  224  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0997293  normal  0.0817193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3285  glycosyl transferase group 1  42.71 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3525  glycosyl transferase group 1  44.48 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4878  hypothetical protein  33.76 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56030  hypothetical protein  33.25 
 
 		 371 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1010  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156875  hitchhiker  0.0000000000138079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1814  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 		 391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4444  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0794772  hitchhiker  0.000041841 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17910  Glycosyl transferase, group 1 family protein  30.08 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1145  glycosyl transferase group 1  22.53 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.69 
 
 		 373 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4353  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 373 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.144729  normal  0.010377 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  28.84 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 381 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3920  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 397 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2839  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 410 aa  92.8  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000929043  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  28.53 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1224  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  28.27 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 395 aa  90.5  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0698  glycosyl transferase group 1  21.71 
 
 		 378 aa  90.5  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  27.42 
 
 		 382 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 417 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  27.42 
 
 		 382 aa  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  27.82 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  30.54 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 		 410 aa  86.3  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  26.4 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  25.26 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  29.93 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  28.35 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.5 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  24.8 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 		 820 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  39.31 
 
 		 871 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  28.2 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  29.71 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7628  Glycosyltransferase-like protein  29.52 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294474  normal  0.180766 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  25.2 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  33.86 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  33.1 
 
 		 816 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  32.32 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 819 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0654  glycosyltransferase  30.45 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.385446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 		 743 aa  77.4  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 		 800 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  37.71 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  25.46 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0567  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.923327  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 		 398 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2581  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  28.72 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>