More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2257 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  100 
 
 
426 aa  850    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  68.48 
 
 
399 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  63.9 
 
 
402 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  58.96 
 
 
399 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5198  glycosyl transferase group 1  56.49 
 
 
426 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.603506  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  50.39 
 
 
800 aa  363  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  43.96 
 
 
397 aa  310  4e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  46.76 
 
 
413 aa  299  7e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  37.6 
 
 
388 aa  296  4e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  41.39 
 
 
398 aa  276  7e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06690  glycosyltransferase  40.72 
 
 
406 aa  249  6e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 
392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  35.52 
 
 
392 aa  212  7.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  27.58 
 
 
387 aa  160  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
390 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  33.33 
 
 
432 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
390 aa  153  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
402 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
398 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 
430 aa  146  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.08 
 
 
385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0825  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  31.9 
 
 
377 aa  140  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
377 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
388 aa  136  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
408 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  27.98 
 
 
430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
367 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
406 aa  134  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
370 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
406 aa  134  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
360 aa  133  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0088  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
369 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.323047  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 
436 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  24.75 
 
 
377 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  24.49 
 
 
377 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.61 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  27.09 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0402  glycosyltransferase, group 1 family protein  25.69 
 
 
443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
743 aa  127  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  24.62 
 
 
373 aa  126  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
376 aa  126  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 
461 aa  126  9e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
405 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
413 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.78 
 
 
769 aa  123  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  23.74 
 
 
377 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
377 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
395 aa  123  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
377 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  29.35 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
385 aa  120  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 
434 aa  120  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
396 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
406 aa  119  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
387 aa  119  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1223  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.862725  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3634  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 
417 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  30.37 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2441  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.9 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.662083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
421 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0701  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
371 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0611  glycosyl transferase, family 1  26.24 
 
 
440 aa  117  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  24.94 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
435 aa  117  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
377 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  24.94 
 
 
382 aa  116  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
415 aa  116  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 
383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
398 aa  114  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 
403 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 
375 aa  113  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
381 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  31.16 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.28 
 
 
373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  27.2 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.27 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0159  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  30.92 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
373 aa  111  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  25.13 
 
 
381 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0461  lipopolysaccharide biosynthesis-related protein  19.71 
 
 
383 aa  110  3e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00755363  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>