More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5160 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
800 aa  1546    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  55.3 
 
 
402 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  49.6 
 
 
397 aa  372  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  50.39 
 
 
426 aa  364  4e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  47.79 
 
 
398 aa  346  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5198  glycosyl transferase group 1  50.77 
 
 
426 aa  343  5e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.603506  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  49.88 
 
 
399 aa  341  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  52.08 
 
 
399 aa  340  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  48.21 
 
 
413 aa  280  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06690  glycosyltransferase  45.08 
 
 
406 aa  277  6e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  34.29 
 
 
388 aa  250  8e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
392 aa  196  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
392 aa  183  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  30.51 
 
 
377 aa  150  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
402 aa  139  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
420 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
377 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  28.79 
 
 
377 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
387 aa  126  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.99 
 
 
400 aa  126  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  27.57 
 
 
377 aa  125  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  35.65 
 
 
375 aa  124  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
376 aa  124  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 
390 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  34.68 
 
 
302 aa  123  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
360 aa  120  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
382 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
377 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
377 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  31.2 
 
 
432 aa  119  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  35.26 
 
 
375 aa  119  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  27.43 
 
 
382 aa  118  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  27.43 
 
 
382 aa  118  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
394 aa  118  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  27.7 
 
 
377 aa  118  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
389 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
385 aa  117  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 
393 aa  117  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  27.86 
 
 
377 aa  117  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
404 aa  115  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.43 
 
 
404 aa  115  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  27.14 
 
 
382 aa  115  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0755  glycosyl transferase, group 1  35.65 
 
 
375 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  36.16 
 
 
301 aa  114  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  29.65 
 
 
381 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  27.6 
 
 
373 aa  114  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.64 
 
 
385 aa  114  8.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
390 aa  114  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0761  glycosyl transferase, group 1  35.65 
 
 
376 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0775  glycosyl transferase, group 1  35.65 
 
 
376 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193821  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
427 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1095  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
383 aa  113  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
430 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07870  glycosyltransferase  32.7 
 
 
391 aa  113  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
373 aa  114  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  31.81 
 
 
434 aa  113  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
381 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  33.83 
 
 
378 aa  111  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
384 aa  110  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
403 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 
378 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  28.65 
 
 
430 aa  109  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  28.02 
 
 
381 aa  109  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  31.15 
 
 
638 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0088  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
369 aa  109  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.323047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
381 aa  107  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  26.93 
 
 
507 aa  107  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
388 aa  107  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  28.61 
 
 
382 aa  107  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
413 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  29.12 
 
 
378 aa  106  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
405 aa  106  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0559  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 
411 aa  106  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3634  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
417 aa  105  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 
375 aa  105  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1234  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
343 aa  105  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000428229 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.4 
 
 
446 aa  105  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
381 aa  104  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
398 aa  104  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 
398 aa  104  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
367 aa  103  9e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  30.06 
 
 
393 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
426 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  29.56 
 
 
381 aa  103  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
406 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
406 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
385 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
395 aa  103  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 
385 aa  102  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
394 aa  101  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  27.3 
 
 
393 aa  101  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
409 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  27.46 
 
 
385 aa  101  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
373 aa  100  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
385 aa  100  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
539 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  42.17 
 
 
386 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>