More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0402 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0402  glycosyltransferase, group 1 family protein  100 
 
 		 443 aa  917    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3634  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  26.14 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.87 
 
 		 385 aa  152  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0825  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 434 aa  150  6e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0461  lipopolysaccharide biosynthesis-related protein  28.81 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00755363  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 		 394 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0159  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 402 aa  140  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 390 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 461 aa  136  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1323  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.15 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0611  glycosyl transferase, family 1  29.49 
 
 		 440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1589  glycosyltransferase  25.47 
 
 		 393 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.679679 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.62 
 
 		 769 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 743 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  25.69 
 
 		 426 aa  127  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1187  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 431 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2441  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.12 
 
 		 446 aa  126  8.000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.662083  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 416 aa  123  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 		 381 aa  122  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  26.32 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0710  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.74 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  24.21 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  22.9 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  26.25 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  27.57 
 
 		 378 aa  113  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5198  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.603506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0387  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.97 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.270074  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 		 392 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1837  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 		 395 aa  108  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 		 373 aa  106  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 388 aa  106  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 413 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06690  glycosyltransferase  25.06 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  24.74 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.76 
 
 		 373 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0648  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  24.53 
 
 		 431 aa  104  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.205035  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0701  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 		 371 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.87 
 
 		 380 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  25.3 
 
 		 406 aa  103  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.81 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  24.81 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.93 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1223  glycosyl transferase group 1  22.56 
 
 		 399 aa  100  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.862725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.81 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 381 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 		 655 aa  99.8  9e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 387 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.93 
 
 		 380 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 378 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.43 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 		 392 aa  98.2  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  23.74 
 
 		 380 aa  98.2  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 		 377 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 		 377 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.56 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 404 aa  96.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 		 396 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.94 
 
 		 404 aa  96.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  20.78 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 441 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.23 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 383 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.4 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 367 aa  94.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 		 381 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  27.33 
 
 		 377 aa  93.2  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2581  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 		 421 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  23.65 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0559  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>