More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0559 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0559  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
411 aa  822    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1223  glycosyl transferase group 1  46.25 
 
 
399 aa  315  8e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.862725  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1837  glycosyl transferase group 1  45.92 
 
 
395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142045  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  37.24 
 
 
377 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
394 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
406 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
406 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  34.47 
 
 
389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 
390 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
403 aa  180  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
385 aa  180  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
398 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 
390 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  33.25 
 
 
400 aa  176  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  31.34 
 
 
769 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.33 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 
743 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
395 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
406 aa  168  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  32.55 
 
 
430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3634  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
398 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.99 
 
 
385 aa  158  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1589  glycosyltransferase  33.01 
 
 
393 aa  157  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.679679 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1323  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  31.06 
 
 
405 aa  155  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271597  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1187  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
431 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0387  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  31.78 
 
 
408 aa  153  5e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.270074  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  33.16 
 
 
377 aa  149  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
377 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
377 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
421 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
377 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  31.92 
 
 
393 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0648  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  29.55 
 
 
431 aa  144  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.205035  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
377 aa  143  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
385 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0825  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
434 aa  143  7e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0461  lipopolysaccharide biosynthesis-related protein  21.5 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00755363  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
435 aa  140  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  30.65 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  28.5 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  28.76 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  30.05 
 
 
381 aa  134  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0611  glycosyl transferase, family 1  31.99 
 
 
440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0710  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.03 
 
 
444 aa  133  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
377 aa  133  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
376 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  30.41 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  32.55 
 
 
374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  30.41 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
378 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  28.8 
 
 
382 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  28.75 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  27.23 
 
 
377 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  27.23 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0088  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.323047  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  27.03 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  28.3 
 
 
377 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  33.61 
 
 
432 aa  127  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
367 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0701  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 
371 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  26.98 
 
 
373 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
403 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0297  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
389 aa  123  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2441  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.37 
 
 
446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.662083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
404 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
399 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.14 
 
 
396 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.21 
 
 
380 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 
381 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 
426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
819 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.22 
 
 
380 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1234  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
343 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000428229 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.02 
 
 
380 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
810 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
816 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  23.22 
 
 
380 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
416 aa  113  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
396 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
363 aa  113  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
812 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.5 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.22 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>