More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3525 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3525  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
417 aa  817    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  53.33 
 
 
381 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3310  glycosyl transferase, group 1  53.58 
 
 
368 aa  335  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1973  glycosyl transferase group 1  50.66 
 
 
370 aa  331  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  52.8 
 
 
368 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  52.8 
 
 
388 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  52.8 
 
 
388 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  52.8 
 
 
388 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3285  glycosyl transferase group 1  45.32 
 
 
395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11940  glycosyltransferase  39.22 
 
 
367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0997293  normal  0.0817193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2238  glycosyl transferase group 1  45.09 
 
 
398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38483  normal  0.0177268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1906  glycosyl transferase, group 1  43.41 
 
 
394 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0659  glycosyl transferase, group 1  40.36 
 
 
370 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1010  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
370 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156875  hitchhiker  0.0000000000138079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.88 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4353  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.144729  normal  0.010377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4444  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
373 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0794772  hitchhiker  0.000041841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 
370 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56030  hypothetical protein  28.87 
 
 
371 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4878  hypothetical protein  28.61 
 
 
371 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1224  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 
372 aa  100  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17910  Glycosyl transferase, group 1 family protein  29.37 
 
 
366 aa  92.8  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
381 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  21.61 
 
 
383 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3920  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
410 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 
446 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  40.83 
 
 
402 aa  77  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 
507 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  28.28 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  37.09 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0611  glycosyl transferase, family 1  26.9 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
820 aa  73.9  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  27.98 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  27.98 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  40.68 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  26.49 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  26.92 
 
 
385 aa  73.2  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  28.69 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
458 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
871 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  30.38 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.46 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.79 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  23.63 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  29.96 
 
 
382 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
377 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.91 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2839  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000929043  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
816 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.68 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.79 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  25.79 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.79 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0569  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  27.08 
 
 
426 aa  67  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0560  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 
374 aa  67  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1145  glycosyl transferase group 1  20.24 
 
 
373 aa  67  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7628  Glycosyltransferase-like protein  36.5 
 
 
372 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294474  normal  0.180766 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
812 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  22.74 
 
 
379 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  29.44 
 
 
803 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>