More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0569 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0569  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
394 aa  792    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  67.09 
 
 
398 aa  530  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  64.81 
 
 
396 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  53.79 
 
 
396 aa  409  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  47.61 
 
 
403 aa  344  2e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 
396 aa  162  8.000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 
394 aa  139  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 
386 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
401 aa  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
387 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  23.47 
 
 
417 aa  109  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
393 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  28.67 
 
 
358 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
355 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
355 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  29.9 
 
 
360 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
426 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
439 aa  99.8  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
355 aa  99.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
415 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
394 aa  96.3  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  31.54 
 
 
401 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
360 aa  95.5  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
384 aa  94.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
377 aa  94  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
364 aa  92.8  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
358 aa  90.9  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 
387 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
424 aa  90.1  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
381 aa  89.7  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  33.65 
 
 
381 aa  90.1  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  28.57 
 
 
382 aa  89.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  26.9 
 
 
420 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  28.57 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.3 
 
 
378 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  29.12 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
376 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
375 aa  87.4  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
370 aa  87.4  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
410 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
421 aa  87  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
377 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
378 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
446 aa  86.7  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
374 aa  86.3  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  29.86 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
455 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4031  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.317277  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  27.1 
 
 
394 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  28.41 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  25.33 
 
 
413 aa  84  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
373 aa  84  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  28.63 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  27.13 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43238  predicted protein  29.15 
 
 
456 aa  83.2  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169779  normal  0.020707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43286  predicted protein  29.15 
 
 
456 aa  83.2  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  normal  0.0628635 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 
367 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  31.58 
 
 
416 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  28.88 
 
 
1232 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
415 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
378 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  27.76 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  29.17 
 
 
377 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  24.72 
 
 
440 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.76 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>