More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2141 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  100 
 
 
416 aa  845    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  35.53 
 
 
394 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  36.48 
 
 
404 aa  219  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
415 aa  156  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
535 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
390 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  26.17 
 
 
414 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
414 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
390 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
475 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  28.87 
 
 
723 aa  127  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
406 aa  126  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
904 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
386 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
405 aa  123  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 
397 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
536 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.74 
 
 
401 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
405 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 
411 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
517 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 
406 aa  113  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  27.4 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 
408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 
399 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
412 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
409 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 
396 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  30.21 
 
 
383 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 
402 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 
359 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 
395 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
348 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.81 
 
 
383 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
399 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  28.22 
 
 
557 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
378 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.34 
 
 
377 aa  106  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
398 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
382 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  30.24 
 
 
388 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
413 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
379 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
419 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
394 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
396 aa  104  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
424 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
387 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
397 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
417 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 
360 aa  103  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  28.62 
 
 
360 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
390 aa  103  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
374 aa  102  9e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
393 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 
427 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
383 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
441 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
427 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
396 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
405 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
398 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
395 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
384 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
391 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
395 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
401 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
379 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
421 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
384 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
360 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
385 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
394 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  28.24 
 
 
1188 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
384 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  32.22 
 
 
351 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
404 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
420 aa  99.8  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  27.13 
 
 
411 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 
394 aa  99.8  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
392 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  28.37 
 
 
569 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
457 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  23.75 
 
 
390 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  30.1 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
394 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>