More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1128 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  100 
 
 
394 aa  805    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  42.68 
 
 
404 aa  281  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  35.53 
 
 
416 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 
386 aa  146  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 
409 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
393 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.4 
 
 
401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
904 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  28.71 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
390 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
390 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
475 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
399 aa  124  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
405 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
535 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  28.93 
 
 
723 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  27.72 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 
418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
411 aa  119  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
398 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
360 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
385 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
517 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
415 aa  117  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
391 aa  116  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.08 
 
 
383 aa  116  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
446 aa  113  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
536 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 
434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
419 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
419 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
389 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.58 
 
 
388 aa  110  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
395 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
416 aa  109  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
386 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
373 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
395 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  31 
 
 
388 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
374 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
390 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
376 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
396 aa  107  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
421 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
403 aa  106  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
417 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
413 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
382 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
370 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
378 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
411 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
394 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
408 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 
410 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 
404 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
414 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
426 aa  103  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
384 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
411 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 
412 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
387 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 
397 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
426 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
370 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
389 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
416 aa  101  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
407 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
408 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
384 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
415 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  28.28 
 
 
360 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
391 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
359 aa  100  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1489  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
395 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113053  normal  0.618426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 
405 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
413 aa  100  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 
360 aa  100  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
405 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
415 aa  99.8  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 
425 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
419 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
439 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
435 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
391 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
373 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  26.38 
 
 
383 aa  98.6  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
398 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>