More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1596 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
386 aa  799    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  55.79 
 
 
386 aa  448  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  49.61 
 
 
395 aa  387  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  44.85 
 
 
394 aa  358  9e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 
396 aa  209  8e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  34.95 
 
 
421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  35.45 
 
 
401 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  31.61 
 
 
358 aa  186  9e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  32.04 
 
 
360 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.28 
 
 
401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 
426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 
439 aa  136  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
415 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 
417 aa  133  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 
403 aa  129  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 
421 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
398 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
411 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
419 aa  124  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
423 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 
360 aa  123  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
387 aa  122  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
672 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
413 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  27.38 
 
 
423 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 
377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
425 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
414 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
386 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
743 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
426 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  29.71 
 
 
650 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  36.9 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  28.52 
 
 
428 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
390 aa  117  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
410 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
402 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  28.75 
 
 
427 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
455 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 
404 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 
355 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  28.79 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
398 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  33.21 
 
 
373 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
358 aa  113  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 
382 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
385 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
391 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
391 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
394 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  34.11 
 
 
404 aa  112  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
395 aa  112  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0569  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  30.31 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 
425 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
422 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
391 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
376 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
398 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
448 aa  110  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
422 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 
383 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  30.28 
 
 
394 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.76 
 
 
435 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
438 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  28.15 
 
 
406 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
453 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
409 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 
406 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
381 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  26.02 
 
 
404 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1496  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
374 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
399 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
378 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
398 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
395 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>