More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0840 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
398 aa  796    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  51.6 
 
 
377 aa  364  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  47.48 
 
 
385 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.01 
 
 
382 aa  334  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2521  putative glycosyl transferase, group 1  47.21 
 
 
385 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329961  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  49.47 
 
 
388 aa  332  8e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  46.15 
 
 
388 aa  332  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  48.68 
 
 
388 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  45.36 
 
 
388 aa  329  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  48.41 
 
 
388 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  48.41 
 
 
388 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  48.41 
 
 
388 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  47.75 
 
 
388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  48.15 
 
 
388 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0552  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  44.47 
 
 
388 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284297  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0909  HepB protein  45 
 
 
388 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2476  glycosyl transferase, group 1 family protein  45 
 
 
388 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2614  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.74 
 
 
388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.419161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  39.79 
 
 
389 aa  277  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  42.86 
 
 
390 aa  272  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1579  glycosyl transferase group 1  36.65 
 
 
358 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.12364  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
399 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0562  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  27.43 
 
 
358 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  33.61 
 
 
396 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  35.69 
 
 
427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 
386 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
426 aa  109  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
536 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  33.66 
 
 
431 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
421 aa  106  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
446 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
394 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
417 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
391 aa  103  8e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 
377 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
395 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
410 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 
381 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  33.47 
 
 
406 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 
388 aa  100  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
414 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
423 aa  99.8  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
377 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
391 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  32.5 
 
 
431 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
434 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
391 aa  97.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 
448 aa  97.4  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  25.74 
 
 
416 aa  97.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
360 aa  96.3  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  26.32 
 
 
360 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0869  a-glycosyltransferase  34.64 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746857  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
398 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  33.99 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
397 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  29.97 
 
 
428 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
386 aa  94  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
414 aa  94.4  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  28.98 
 
 
414 aa  94.4  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
382 aa  93.2  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
396 aa  92.8  8e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0611  glycosyl transferase, family 1  28.14 
 
 
440 aa  93.2  8e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
373 aa  92.8  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
395 aa  92.8  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
439 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  32.59 
 
 
418 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
411 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  32.1 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
417 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  30 
 
 
383 aa  90.9  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
359 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.84 
 
 
435 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
395 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 
359 aa  90.9  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
401 aa  90.9  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31.95 
 
 
370 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 
399 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  22.57 
 
 
380 aa  90.5  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
416 aa  90.1  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
364 aa  90.1  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
439 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
374 aa  90.1  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>