More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3732 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  96.65 
 
 
388 aa  721    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  96.13 
 
 
388 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  95.88 
 
 
388 aa  716    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  99.74 
 
 
388 aa  771    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  96.13 
 
 
388 aa  717    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  95.62 
 
 
388 aa  712    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
388 aa  771    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0552  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  81.14 
 
 
388 aa  631  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284297  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  80.67 
 
 
388 aa  624  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  80.15 
 
 
388 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  80.47 
 
 
385 aa  617  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0909  HepB protein  80.88 
 
 
388 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2614  glycosyl transferase, group 1 family protein  80.88 
 
 
388 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.419161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2476  glycosyl transferase, group 1 family protein  80.88 
 
 
388 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2521  putative glycosyl transferase, group 1  54.66 
 
 
385 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329961  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.5 
 
 
382 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  53.85 
 
 
377 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  47.48 
 
 
398 aa  338  9e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  40.48 
 
 
390 aa  281  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  38.73 
 
 
389 aa  270  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1579  glycosyl transferase group 1  39.79 
 
 
358 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.12364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 
404 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
413 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
391 aa  110  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
410 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
446 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
391 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 
391 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
398 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
401 aa  107  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
396 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
415 aa  106  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
395 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  26.72 
 
 
358 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  39.15 
 
 
384 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0562  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
368 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
415 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
421 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
390 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
420 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
408 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
394 aa  100  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 
382 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
417 aa  96.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
397 aa  96.7  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 
448 aa  96.3  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 
386 aa  96.3  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  27.83 
 
 
360 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 
770 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
419 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
376 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
360 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3898  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
433 aa  93.6  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
386 aa  93.2  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  22.98 
 
 
536 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  34.02 
 
 
434 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
457 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
386 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 
426 aa  92.4  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
399 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
414 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
384 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  30.03 
 
 
420 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  31.09 
 
 
397 aa  90.9  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
370 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
373 aa  90.1  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 
379 aa  89.7  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
382 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  24.94 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
396 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
411 aa  87  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  33.97 
 
 
466 aa  87  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
388 aa  87  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
391 aa  86.3  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  28.52 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  30.34 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  34.97 
 
 
443 aa  84  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
405 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
378 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
455 aa  83.6  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  31.83 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
402 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>