More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2237 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  84.38 
 
 
385 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
388 aa  771    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  98.2 
 
 
388 aa  761    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0552  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  81.98 
 
 
388 aa  627  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284297  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  81.19 
 
 
388 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  80.67 
 
 
388 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0909  HepB protein  81.72 
 
 
388 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  80.67 
 
 
388 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  80.41 
 
 
388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  80.67 
 
 
388 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2614  glycosyl transferase, group 1 family protein  81.72 
 
 
388 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.419161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2476  glycosyl transferase, group 1 family protein  81.72 
 
 
388 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  80.15 
 
 
388 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  80.15 
 
 
388 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2521  putative glycosyl transferase, group 1  55.99 
 
 
385 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329961  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  53.85 
 
 
382 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  54.91 
 
 
377 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  45.36 
 
 
398 aa  329  6e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  40.21 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  40.58 
 
 
390 aa  282  8.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1579  glycosyl transferase group 1  38.07 
 
 
358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.12364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  46.3 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
391 aa  113  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 
410 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
390 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0562  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
368 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
408 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
413 aa  103  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
395 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  25.68 
 
 
358 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 
415 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 
397 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 
421 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
417 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
391 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
386 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
386 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
376 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
382 aa  97.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  26.93 
 
 
398 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
396 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
414 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  38.79 
 
 
384 aa  94.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
411 aa  94.4  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
396 aa  93.6  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
386 aa  93.6  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
414 aa  93.2  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  29.43 
 
 
414 aa  93.2  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 
770 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
399 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
426 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  24.82 
 
 
384 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
394 aa  92  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
390 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  33.55 
 
 
418 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
415 aa  90.5  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1055  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
372 aa  90.5  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  33.06 
 
 
443 aa  90.5  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.22 
 
 
405 aa  89.7  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
399 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  23.55 
 
 
373 aa  89.7  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
370 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
406 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
415 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
421 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
388 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  35.81 
 
 
388 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  33.11 
 
 
434 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  26.42 
 
 
360 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
453 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  36.3 
 
 
402 aa  88.6  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
402 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
420 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
414 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
405 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
404 aa  87.4  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
369 aa  87  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
373 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
414 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
423 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
439 aa  87  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  28.62 
 
 
406 aa  87  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  28.76 
 
 
417 aa  86.3  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  29.41 
 
 
420 aa  86.3  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
360 aa  86.3  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
419 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 
405 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
477 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>