More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3829 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  96.13 
 
 
388 aa  717    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  96.65 
 
 
388 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0552  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  81.91 
 
 
388 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284297  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
388 aa  771    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  99.74 
 
 
388 aa  770    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  95.88 
 
 
388 aa  716    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
388 aa  771    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  95.88 
 
 
388 aa  712    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  81.19 
 
 
388 aa  628  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  80.67 
 
 
388 aa  624  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  81.25 
 
 
385 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0909  HepB protein  81.14 
 
 
388 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2476  glycosyl transferase, group 1 family protein  81.14 
 
 
388 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2614  glycosyl transferase, group 1 family protein  81.14 
 
 
388 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.419161  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2521  putative glycosyl transferase, group 1  55.67 
 
 
385 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329961  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.29 
 
 
382 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  53.85 
 
 
377 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  47.21 
 
 
398 aa  335  7.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  40.75 
 
 
390 aa  280  4e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  39.26 
 
 
389 aa  272  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1579  glycosyl transferase group 1  39.28 
 
 
358 aa  173  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.12364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
391 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
401 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
410 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
395 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
446 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0562  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
368 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
413 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
415 aa  103  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
415 aa  102  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  26.47 
 
 
358 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 
421 aa  102  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
391 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
398 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
391 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
396 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
382 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  38.72 
 
 
384 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
390 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
408 aa  99.8  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  28.5 
 
 
360 aa  99.8  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
420 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
395 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 
419 aa  96.7  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3898  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
433 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
384 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 
448 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 
770 aa  94.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
417 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  22.45 
 
 
397 aa  93.6  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
399 aa  93.2  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
457 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
386 aa  93.2  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 
386 aa  92.8  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
406 aa  92.8  9e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  34.43 
 
 
434 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  29.72 
 
 
420 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  25.69 
 
 
417 aa  90.5  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
414 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
426 aa  90.5  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
360 aa  90.1  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
379 aa  89.7  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  32.97 
 
 
466 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 
396 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
411 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
426 aa  88.2  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
370 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.4 
 
 
360 aa  87.4  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
391 aa  87  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
438 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
380 aa  87.4  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
406 aa  87  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
405 aa  87  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
382 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  32.14 
 
 
397 aa  87  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 
419 aa  86.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 
439 aa  86.7  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.24 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  37.22 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  30.67 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 
536 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
439 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  28.78 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>