More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1473 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  797    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  39.07 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 
384 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  29.4 
 
 
388 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
370 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  37.74 
 
 
408 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
374 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
376 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
399 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
374 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  28.54 
 
 
385 aa  156  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
376 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 
770 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
359 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  27 
 
 
399 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
375 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
386 aa  149  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
375 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
375 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 
378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 
378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
373 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
376 aa  147  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
381 aa  146  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
374 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
382 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
384 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  28.72 
 
 
382 aa  143  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 
389 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 
380 aa  140  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  34.73 
 
 
380 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
377 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
378 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  33.2 
 
 
378 aa  136  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3917  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
380 aa  135  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  37.39 
 
 
409 aa  133  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
413 aa  131  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  28.68 
 
 
383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.81 
 
 
388 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 
353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
422 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  34.69 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
423 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
386 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 
390 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
672 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
414 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 
408 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 
396 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
536 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  34.58 
 
 
396 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
369 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  26.33 
 
 
404 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
409 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2738  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  25.4 
 
 
935 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
413 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
414 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.54 
 
 
401 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
382 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
440 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
426 aa  112  9e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
748 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 
446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.45 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  25.25 
 
 
650 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
438 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 
419 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 
382 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
373 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
438 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
395 aa  110  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
390 aa  109  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
392 aa  109  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
439 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
439 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3893  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
374 aa  109  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
395 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
399 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.33 
 
 
770 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  30.21 
 
 
416 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3845  group 1 glycosyl transferase  25.87 
 
 
411 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452091  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 
360 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>