More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10750 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  100 
 
 
399 aa  782    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  76.46 
 
 
376 aa  561  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  67.47 
 
 
373 aa  482  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  64.1 
 
 
374 aa  455  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  63.66 
 
 
376 aa  451  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  64.38 
 
 
375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  64.38 
 
 
375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  64.64 
 
 
375 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  62.17 
 
 
374 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  64.04 
 
 
385 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  64.19 
 
 
382 aa  428  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  65.52 
 
 
376 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  57.07 
 
 
390 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  64.29 
 
 
374 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  65.17 
 
 
378 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  62.23 
 
 
377 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  56.57 
 
 
388 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  61.7 
 
 
376 aa  388  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  57.37 
 
 
374 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  59 
 
 
379 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  58.18 
 
 
370 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3243  glycosyl transferase group 1  54.71 
 
 
396 aa  338  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0322741  normal  0.0997913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  53.66 
 
 
384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  48.24 
 
 
374 aa  302  6.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  46.17 
 
 
423 aa  298  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  53.68 
 
 
398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  49.2 
 
 
422 aa  282  8.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  44.85 
 
 
377 aa  210  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
384 aa  160  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  27.76 
 
 
383 aa  152  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  35.03 
 
 
770 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
381 aa  142  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 
409 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
386 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
384 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  26.72 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
359 aa  119  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
410 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
408 aa  116  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 
370 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  31.27 
 
 
770 aa  113  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
378 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
424 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  32.58 
 
 
378 aa  109  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  37.84 
 
 
395 aa  109  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.96 
 
 
365 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 
378 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  37.07 
 
 
810 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
373 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  33.44 
 
 
404 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  36.64 
 
 
426 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.18 
 
 
404 aa  103  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
380 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
403 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
404 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  37.16 
 
 
377 aa  103  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
384 aa  102  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
360 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 
414 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
376 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
387 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  37.09 
 
 
422 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
394 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  30.81 
 
 
383 aa  100  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
446 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
422 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
374 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
419 aa  99.8  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
399 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
409 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 
408 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 
425 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0937  glycosyl transferase group 1  34.4 
 
 
369 aa  98.6  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 
373 aa  98.6  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.06 
 
 
409 aa  98.2  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 
415 aa  97.4  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
519 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  37.86 
 
 
402 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  37.9 
 
 
413 aa  97.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
417 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 
426 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  34.56 
 
 
466 aa  96.7  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 
427 aa  96.3  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  30.35 
 
 
385 aa  96.3  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  26.61 
 
 
380 aa  96.3  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 
426 aa  96.3  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
405 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 
819 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
392 aa  95.9  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>