More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3047 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 374 aa  741    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  65.96 
 
 		 376 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  64.1 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  64.46 
 
 		 375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  64.46 
 
 		 375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  64.46 
 
 		 375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  62.7 
 
 		 382 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  62.17 
 
 		 385 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  62.4 
 
 		 376 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  62.96 
 
 		 378 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  56.84 
 
 		 373 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  54.38 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  56.68 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  54.69 
 
 		 376 aa  381  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  54.55 
 
 		 374 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  55.23 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  57.18 
 
 		 374 aa  358  8e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  55.5 
 
 		 376 aa  343  4e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  54.01 
 
 		 377 aa  338  8e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  52.78 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  52.56 
 
 		 370 aa  329  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  45.09 
 
 		 374 aa  288  8e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  43.85 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3243  glycosyl transferase group 1  46.58 
 
 		 396 aa  282  7.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0322741  normal  0.0997913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  47.63 
 
 		 384 aa  282  8.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  44.32 
 
 		 422 aa  264  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  49.6 
 
 		 398 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  43.01 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  28.07 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  32.59 
 
 		 770 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 389 aa  146  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 		 409 aa  143  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  26.28 
 
 		 382 aa  123  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  30.31 
 
 		 383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.13 
 
 		 770 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 		 378 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 371 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 		 424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  33.61 
 
 		 935 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  39.69 
 
 		 404 aa  106  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.48 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 		 422 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 		 410 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  36.2 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  28.14 
 
 		 378 aa  103  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 419 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.6 
 
 		 365 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  28.51 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.39 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0937  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.82 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 		 364 aa  99.4  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 380 aa  99.4  9e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  32.13 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 		 430 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.04 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 353 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 446 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 384 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.54 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 		 810 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  36.15 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1640  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 384 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 		 414 aa  96.7  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 		 415 aa  96.7  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 394 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.54 
 
 		 407 aa  96.3  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2738  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 400 aa  96.3  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 406 aa  96.7  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 		 406 aa  96.7  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 		 422 aa  96.3  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 		 440 aa  96.3  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>