More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1085 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 430 aa  882    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  49.06 
 
 		 381 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1737  glycosyl transferase, group 1  49.6 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3818  glycosyl transferase, group 1  46.52 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.406425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  44.99 
 
 		 519 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  44.12 
 
 		 378 aa  331  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  43.43 
 
 		 378 aa  325  7e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1640  glycosyl transferase group 1  41.03 
 
 		 384 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2078  glycosyl transferase group 1  41.24 
 
 		 396 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5426  glycosyl transferase group 1  40.43 
 
 		 396 aa  299  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4996  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  23.8 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 375 aa  110  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 		 395 aa  106  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  22.96 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 		 419 aa  104  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4100  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  24.49 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4039  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  23.83 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3913  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  24.24 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.0414199 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 536 aa  100  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 396 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3932  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  24.24 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 396 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3994  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  23.74 
 
 		 381 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  28.23 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 		 376 aa  96.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  23.54 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 		 399 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  26.1 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 		 395 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 424 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 		 374 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 		 415 aa  93.6  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 		 396 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 		 422 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  26.46 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 397 aa  90.1  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  27.38 
 
 		 432 aa  90.1  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 		 374 aa  90.1  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 389 aa  90.1  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 		 379 aa  89.7  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  27.44 
 
 		 398 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  22.7 
 
 		 413 aa  89.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  21.97 
 
 		 446 aa  89  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  21.63 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  28.12 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 409 aa  87.4  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 417 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 373 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  23.13 
 
 		 442 aa  87  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  23.4 
 
 		 407 aa  86.7  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 		 421 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  23.33 
 
 		 395 aa  86.7  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 		 426 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  23.47 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 		 389 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 378 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 396 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  25.67 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1120  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 537 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  27.92 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  25.29 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 		 672 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  25 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>