More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0937 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0937  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
369 aa  707    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  39.28 
 
 
377 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  40.35 
 
 
379 aa  149  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  37.92 
 
 
388 aa  144  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  36.39 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  35.99 
 
 
374 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  35.88 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  37.39 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  36.81 
 
 
375 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  36.81 
 
 
375 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  37.07 
 
 
375 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
374 aa  119  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  38.62 
 
 
377 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  36.56 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  39.82 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
376 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  37.68 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  36.2 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  35.21 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  35.53 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  34.4 
 
 
399 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
386 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3243  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 
396 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0322741  normal  0.0997913 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  28.83 
 
 
370 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  33.8 
 
 
382 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  42.7 
 
 
450 aa  96.3  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  28.86 
 
 
372 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  38.67 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
423 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  37.55 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  35.02 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  39.67 
 
 
427 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 
408 aa  89.7  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
477 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  37.79 
 
 
443 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
386 aa  88.2  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  41.4 
 
 
431 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  36.87 
 
 
439 aa  87.8  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  35.32 
 
 
438 aa  87.4  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  39.23 
 
 
466 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
424 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  37.57 
 
 
458 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  32.36 
 
 
770 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  39.25 
 
 
448 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  37.25 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  38.27 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  29.74 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  31.92 
 
 
422 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  38.54 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
417 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  39.68 
 
 
482 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
362 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  36.7 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  26.91 
 
 
770 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  37.84 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
436 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  38.74 
 
 
435 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  40.76 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  28.79 
 
 
935 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  38.74 
 
 
480 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  35.08 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  34.76 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  35.38 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  31.38 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  34.36 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
414 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
419 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  37.78 
 
 
448 aa  77  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  37.89 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4996  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  24.47 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180671  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
820 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
372 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  35.16 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  36.7 
 
 
443 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  34.38 
 
 
816 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  22.85 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>