More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1191 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
384 aa  792    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  44.59 
 
 
382 aa  353  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  45.57 
 
 
386 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  33.16 
 
 
383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  31.17 
 
 
383 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
770 aa  169  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  28.64 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  28.5 
 
 
399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 
359 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 
370 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
376 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
373 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
374 aa  144  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
374 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
390 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  37.56 
 
 
376 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
389 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
408 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
409 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  34.63 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  40.34 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
375 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
375 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  39.2 
 
 
382 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
377 aa  126  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
409 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 
380 aa  123  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  34.27 
 
 
385 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
389 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
373 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.02 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
355 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
378 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  36.28 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
410 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
385 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.35 
 
 
770 aa  113  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  28.15 
 
 
378 aa  113  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
810 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.84 
 
 
388 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
365 aa  110  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3243  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
396 aa  109  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0322741  normal  0.0997913 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 
395 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
399 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  29.23 
 
 
404 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
408 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
419 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
384 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.74 
 
 
382 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
355 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
404 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  28.74 
 
 
458 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
378 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
355 aa  106  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
426 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  27.58 
 
 
369 aa  106  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
457 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
389 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
415 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  29.48 
 
 
404 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24.84 
 
 
427 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
438 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
364 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
438 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  25.54 
 
 
425 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
377 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0793  Glycosyltransferase-like protein  26.09 
 
 
384 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 
419 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 
409 aa  103  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  34.97 
 
 
383 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 
389 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
355 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
378 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
421 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  31.66 
 
 
393 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 
370 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
377 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
434 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.54 
 
 
360 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
395 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>