More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3236 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
374 aa  726    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  62.96 
 
 
376 aa  438  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  62.17 
 
 
399 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  60.8 
 
 
375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  60.8 
 
 
375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  60.8 
 
 
375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  58.76 
 
 
373 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  58.82 
 
 
376 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  56.18 
 
 
388 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  55.76 
 
 
376 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  57.89 
 
 
385 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  56.68 
 
 
374 aa  371  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  58.73 
 
 
382 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  56.03 
 
 
374 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  58.99 
 
 
378 aa  362  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  55.31 
 
 
379 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  57.87 
 
 
374 aa  351  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  56.72 
 
 
377 aa  342  9e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
390 aa  338  9e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  57.41 
 
 
376 aa  335  7.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  54.32 
 
 
370 aa  332  8e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3243  glycosyl transferase group 1  51.57 
 
 
396 aa  298  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0322741  normal  0.0997913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  51.05 
 
 
384 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  45.99 
 
 
423 aa  285  7e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  53.48 
 
 
398 aa  281  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  49.6 
 
 
422 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  44.59 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  35.79 
 
 
381 aa  145  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  27.74 
 
 
383 aa  145  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  35.53 
 
 
383 aa  142  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
384 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 
409 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
384 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
419 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 
770 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
373 aa  123  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  28.21 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  41.76 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
414 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  40.41 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  40.54 
 
 
395 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
389 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  39.49 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  35.88 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  29.55 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
373 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
360 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  20.79 
 
 
359 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
399 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  35.27 
 
 
380 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  36.2 
 
 
385 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  29.02 
 
 
378 aa  107  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
389 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  31.17 
 
 
381 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
378 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3917  glycosyl transferase group 1  38.33 
 
 
380 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
464 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  39.32 
 
 
414 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
378 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 
378 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
394 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
360 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 
370 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.65 
 
 
404 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 
440 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
391 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  30.28 
 
 
377 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0937  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
369 aa  100  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  29.49 
 
 
385 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  42.31 
 
 
398 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
414 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.17 
 
 
365 aa  99.8  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  34.2 
 
 
364 aa  99.4  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5045  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
415 aa  99.4  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
355 aa  99.4  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  38.55 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  36.28 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  26.98 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  36.21 
 
 
351 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.94 
 
 
365 aa  97.8  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
414 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
353 aa  97.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  35.39 
 
 
417 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  36.74 
 
 
756 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 
364 aa  96.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
392 aa  96.7  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
415 aa  96.3  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 
403 aa  96.7  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
426 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
380 aa  95.5  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  34.56 
 
 
466 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 
417 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>