More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4446 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
426 aa  861    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  81.84 
 
 
396 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0391  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  37.84 
 
 
392 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
410 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  33.22 
 
 
404 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
380 aa  117  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 
421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.07 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
398 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
412 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3316  glycosyltransferase-like protein  30.26 
 
 
395 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
406 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  36.45 
 
 
353 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
414 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
437 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  30.35 
 
 
358 aa  106  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
419 aa  106  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.5 
 
 
409 aa  106  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
406 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 
377 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
411 aa  106  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  36.64 
 
 
371 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
373 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
375 aa  104  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
410 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
390 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  37.36 
 
 
367 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
376 aa  103  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.37 
 
 
400 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  40.8 
 
 
402 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.58 
 
 
378 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
414 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
408 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 
400 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.23 
 
 
388 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  33.47 
 
 
422 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  38.25 
 
 
398 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
386 aa  100  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  30.51 
 
 
388 aa  100  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
374 aa  99.8  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
373 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
810 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 
416 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
412 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  35.4 
 
 
405 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
411 aa  99  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 
413 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  33.81 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
393 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  39.38 
 
 
800 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
421 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
426 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
415 aa  99  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  36.08 
 
 
418 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  28.22 
 
 
935 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
391 aa  98.6  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  37.17 
 
 
411 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
384 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.8 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
689 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 
402 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  37.69 
 
 
374 aa  97.8  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 
374 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 
536 aa  97.4  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
395 aa  97.1  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  27.72 
 
 
369 aa  97.1  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
370 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
397 aa  97.1  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 
394 aa  97.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  37.7 
 
 
400 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  33.14 
 
 
420 aa  97.1  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
379 aa  97.1  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  35.6 
 
 
350 aa  97.1  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
360 aa  96.7  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
391 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  34.29 
 
 
399 aa  96.7  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 
419 aa  96.7  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
409 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  35 
 
 
365 aa  96.3  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
455 aa  96.3  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
379 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
770 aa  96.3  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
376 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  37.96 
 
 
396 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  45.7 
 
 
453 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.96 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
415 aa  94.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>